m1A-seq结果表明m1A在第一个剪接位点上游起始密码子周围富集:m1A倾向于修饰翻译起始位点周围一些更结构化的区域,可以对生理条件做出动态响应,并与蛋白质生成呈正相关。这些特异性特征在小鼠与人类细胞中高度保守,证明了m1A在促进mRNA甲基化翻译中发挥作用。 图:m1A-seq表明m1A与人转录组中的翻译起始位点(TIS)相关...
MeRIP-Seq (m6A-seq, m1A-seq, m5C-seq, m7G-seq) m6A研究背景 m1A研究背景 m5C研究背景 m7G研究背景 服务特点 实验流程 结果展示 m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)是真核生物mRNA内部序列中最常见的一种甲基化修饰,同时可以功能性的调节真核生物的转录组从而影响mRNA的剪接、出核、定位、翻译和稳定。m6...
图2-34. m1A-seq 显示野生组和 ALKBH3-/-HeLa 细胞ATP5D 基因 CDS 区的 m1A 富集峰 图2-35. 两组细胞的 ATP5D 基因的 mRNA 表达水平(RNA-seq) 与核糖体足迹(Ribo-seq)广州表观生物科技有限公司 扫码关注 快捷导航 科学顾问 公司介绍 联系我们 联系方式: 020-89855770 联系地址: 广州市黄埔区揽月路3...
由于ALKBH3负责去除m1A修饰,首先对眼黑色素瘤细胞和正常黑素细胞进行了m1A MeRIP-seq。结果表明,从正常细胞和肿瘤细胞生成m1A MeRIP-seq文库中,平均鉴定出16 864个和10 212个m1A峰(图4A-B)。与之前的m1A MeRIP-seq结果一致,m1A峰在5个UTR中富集,特别是在起始密码子附近。差异表达的m1A修饰基因与多种黑色素...
(e-f)展示AC番茄中分别在MG和Br+6阶段与mRNA m1A甲基化相关的前三个motif。 通过RNA-seq和m1A MeRIP-seq的联合分析,我们发现其中具有837个高甲基化位点的714个差异表达的mRNA中有450个差异表达mRNA表现出表达量升高的表达趋势,另外264个差异表达mRNA表现出表达量降低的趋势。相反,在具有942个低甲基化位点的818...
项目名称:m1a-meRIP-seq 所属分类:RNA 修饰 联系电话:020-85625352 QQ:386244141 Email:servers@gzscbio.com 技术服务描述 m1A是一类新发现的RNA甲基化修饰,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上发生甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。m1A已经在tRNA、rRNA、mRNA和non-coding RNA上被发现...
随着NGS的广泛应用,RNA修饰得到了广泛研究,已是表观遗传领域的热点之一,而MeRIP-seq则是研究m1A修饰强有力的技术之一。该技术是将MeDIP、RIP及RNA-seq技术结合起来,在全基因组范围内精确检测RNA甲基化,对RNA样品进行片段化,利用特异性的RNA甲基化抗体进行免疫共沉淀反应,将获得的甲基化修饰片段测序。同时,需要设计...
Arraystar mRNA&lncRNA表观转录组芯片,可定量检测mRNA&lncRNA中m6A/m5C/m1A/ac4C/m7G/Ψ的表观转录修饰水平。对于m6A修饰,我们提供了两种m6A- RNA富集方法可供选择:m6A抗体免疫沉淀(MeRIP)或GST-YTH pull down富集。 芯片优势 与MeRIP-seq相比,Arraystar表观转录组芯片有其独特的优势: ...
set mfe device check-crc-seq命令用来使能或去使能转发面CRC/sequence校验告警功能。 命令格式 set mfe slotslot-idmfe-idmfe-iddevicecheck-crc-seq{on|off} 参数说明 参数参数说明取值 mfe-idmfe-id 多核转发引擎ID,根据硬件的不同而具有不同的取值范围。
set mfe slot slot-id mfe-id mfe-id device check-crc-seq { on | off } Parameters ParameterDescriptionValue mfe-id mfe-id Specifies the ID of a multi-core forwarding engine. The value range varies with hardware. - slot slot-id Specifies a slot ID. The value range varies depending...