由于lncRNA发现较晚,功能研究不完善,因此,我们可以以mRNA为桥梁对lncRNA的功能进行推断和研究。通常将lncRNA的功能分成cis和trans两种(图2)。Cis作用的原理是lncRNA的功能与其临近mRNA相关,可以以lncRNA基因组坐标上下游100 kb的mRNA作为lncRNA的靶基因进行研究。而trans作用的原理是lncRNA与其共表达的mRNA相关,可以根...
服务详情 言行生物提供各种miRNA/lncRNA/环状RNA/mRNA的共表达网络图,可以进行关联分析,从多层次深入阐述分子机制。 结果展示 1、miRNA和mRNA共表达网络图 2、lncRNA和mRNA共表达网络图 3、mRNA共表达网络图首页 联系我们 留言板 第三代测序服务 代谢组学服务 生物信息学服务 蛋白质组学服务 CRISPR/...
由于lncRNA发现较晚,功能研究不完善,因此,我们可以以mRNA为桥梁对lncRNA的功能进行推断和研究。通常将lncRNA的功能分成cis和trans两种(图2)。Cis作用的原理是lncRNA的功能与其临近mRNA相关,可以以lncRNA基因组坐标上下游100kb的mRNA作为lncRNA的靶基因进行研究。而trans作用的原理是lncRNA与其共表达的mRNA相关,可以根据...
通常将lncRNA的功能分成cis和trans两种(图2)。Cis作用的原理是lncRNA的功能与其临近mRNA相关,可以以lncRNA基因组坐标上下游100kb的mRNA作为lncRNA的靶基因进行研究。而trans作用的原理是lncRNA与其共表达的mRNA相关,可以根据表达量计算相关性以预测lncRNA的靶基因(一般要求样品数超过6个),从而研究lncRNA的功能。 图2...
图12.选择source和target,其中lncRNA为source,mRNA为target 图13.默认网络图 8.网络图美化 经过对颜色,节点形状,线型,布局等的简单美化后,获得最终的lncRNA-mRNA共表达网络图(图12)。由于每个人的审美不同,因此这里需要花费大量的时间进行美化,有些研究者还会使用AI等软件给网络图添加背景色等进行进一步优化。
图12.选择source和target,其中lncRNA为source,mRNA为target 图13.默认网络图 8.网络图美化 经过对颜色,节点形状,线型,布局等的简单美化后,获得最终的lncRNA-mRNA共表达网络图(图12)。由于每个人的审美不同,因此这里需要花费大量的时间进行美化,有些研究者还会使用AI等软件给网络图添加背景色等进行进一步优化。
图12. 选择source和target,其中lncRNA为source,mRNA为target 图13. 默认网络图 8. 网络图美化 经过对颜色,节点形状,线型,布局等的简单美化后,获得最终的lncRNA-mRNA共表达网络图(图12)。由于每个人的审美不同,因此这里需要花费大量的时间进行美化,有些研究者还会使用AI等软件给网络图添加背景色等进行进一步优化。
图12.选择source和target,其中lncRNA为source,mRNA为target 图13.默认网络图 8.网络图美化 经过对颜色,节点形状,线型,布局等的简单美化后,获得最终的lncRNA-mRNA共表达网络图(图12)。由于每个人的审美不同,因此这里需要花费大量的时间进行美化,有些研究者还会使用AI等软件给网络图添加背景色等进行进一步优化。