包括lncRNA与核染色质结构的连接、表观遗传学过程、增强子功能和生物分子缩合物，以及lncRNA在细胞核外的...
2.GO和KEGG富集结果 3.上调lncRNAs的网络 4.下调lncRNAs的网络 5.关键lncRNA‑mRNA‑biological processes subnetwork
(lncRNA,mRNA和miRNA)进行临床样本验证.结果 共有99个lncRNA,46个miRNA和73个mRNA分子参与调控网络的构建.GO和KEGG分析表明失调的mRNA主要参与小细胞肺癌的细胞癌变,增殖以及转移.PPI网络分析提示46个基因被认为是中心基因.qPCR结果显示,与癌旁组织比较,小细胞肺癌组织中lnc-ENST00000430027.3呈相对高表达(P<0.001),...
构建的共表达网络包括739个节点及17375个连接,其中lncRNA65个,miRNA3个,mRNA671个,占整个差异表达基因的16.1%.网络中的关键基因CDKl(P〈0.001),RPll-214F16.8(P=0.048)和MIR27A(P=0.027)在肿瘤组织中的表达均高于正常癌旁组织.低表达RPll-214F16.8,MIR27A患者总体生存显著好于高表达患者,均P值〈O.001;CDK...
lncRNA作为竞争性内源性RNA(competitive endogenous RNAs,ceRNAs)可能与中性粒细胞凋亡密切相关.但其具体调控机制目前仍不十分清楚.本研究通过检测中性粒细胞自发性凋亡过程中miRNA,lncRNA,mRNA的差异表达,使用生物信息学的方法构建lncRNA-miRNA-mRNA内源竞争性RNA网络,并分析获得中性粒细胞自发性凋亡过程中的关键lncRNA....
摘要 目的研究盾叶冠心宁片抗ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化的作用及机制。方法40只ApoE-/-小鼠随机分为空白组、模型组、可定组、盾叶组,每组10只。空白组给予基础饲料,其余各组均...展开更多 作者 李艳霞 李益萍 王肖龙 机构地区 上海中医药大学附属曙光医院 出处 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期...
阿尔茨海默病ceRNA调控网络的生物信息学分析 的预测.最后构建circRNA-miRNA-mRNA和lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络,并进行分析,这将有助于理解和阐明AD的发病机制,并为AD的临床诊断提供可能选择的生物标志物... 李壬清,刘济嘉,杜景考,... - 《生物物理学》 被引量: 0发表: 2022年 Comprehensive Analysis of ...
生物信息学利用生物信息学筛选差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs),构建前列腺癌(Prostate Cancer,PCa)单细胞层面lncRNA-miRNA-mRNA调控网络,在分子水平上研究前列腺癌的发生发展过程及预后指标.首先从基因表达综合数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库分别下载单细胞RNA测序数据... 查看全部>>莫泳锋...