001、进入ncbi官网 002、点击blast 0 003、点击download blast 004、点击如下链接: 005、点击下载linux 64位: 下载链接:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 006、下载完成后,上传至linux系统 007、解压并进入命令目录 tar -xzvf ncbi-blast-2.14.0+-x64-linux.tar.gz cd ncbi-b...
1. 下载软件BLAST: 在以下网址ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 下载: ncbi-blast-2.2.29+-x64-linux.tar.gz (根据自己的操作系统选择)。 2. 解压: 解压后放在任意目录下都可以,把相应路径加入PATH变量就是。 比如解压到用户的主目录(/home/yonpen)下,把解压后的文件夹重新...
一、下载Blast安装包 到Blast的官网(https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/)下载你系统对应的安装包,为了防止文件下载出错,你还可以下载对应的MD5文件进行校验。这里我们下载linux版本的(ncbi-blast-2.10.0+-x64-linux.tar.gz)。下载速度看你网速,可以考虑去弄杯咖啡喝(*^_^*) 二、...
blastdb_aliastool blast_formatter blastx deltablast legacy_blast.pl makeprofiledb rpstblastn tblastx blastdbcheck blastn cleanup-blastdb-volumes.py dustmasker makeblastdb psiblast segmasker update_blastdb.pl blastdbcmd blastp convert2blastmask get_species_taxids.sh makembindex rpsblast tblastn wind...
blast软件安装 从NCBI下载安装包https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/。下载2.11.0 linux版本,下载并解压,解压之后BLAST就安装好了。用户需要设置环境变量,目的是为了告诉系统在那里可以找到安装好的BLAST软件。 wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi...
建议新建biosoft、bin、src文件夹分别放置源文件、快捷方式、安装压缩包 一、序列比对 1 blast+ 2 diamond #类似于blast,其速度巨快 3 b...
这些都需要序列比对来判断,并且使用一些方法和标准来进行评价。...blast 比对中默认使用的就是 BLOSUM62 打分矩阵。其中 62 表示用来构建该矩阵的匹配数据集中精确匹配位点要占 62%。...2009年 7 月,NCBI 发布了 BLAST 升级版——BLAST+,BLAST+使用了 BLAST 的核心算法..
#如果需要GetOrganelle软件包自带程序SPAdes, Bowtie2, Blast,需要下载 GetOrganelleDep目录,参照以下步骤: cd GetOrganelle#进入目录 GetOrganelle wget https://github.com/Kinggerm/GetOrganelleDep/releases/download/v1.6.0/v1.6.0-linux.tar.gz#下载Linux版本的GetOrganelleDep ...
第一步:安装BLAST 在Linux系统中,BLAST有如下几个版本可供选择:BLAST+和NCBI BLAST。BLAST+是由NCBI提供的较新版本,拥有更多的功能和改进的性能。NCBI BLAST是由NCBI提供的经典版本。在本文中,我们将介绍如何安装BLAST+。 1.打开终端并使用sudo su命令切换到超级用户模式。 sudo su 2.更新软件包列表。 apt-get ...
Linux下BLAST+的使用注意,此blast已更名为blast+,目前网上中文教程多为11年之前的老版本的blast的教程,此教程为最新版本1.软件简介核苷酸及蛋白质序列比对2.软件获取及安装2.1.获取在window系统下,利用浏览器,进入:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/中下载blastlinux64位(目前最新版本:...