001、进入ncbi官网 002、点击blast 0 003、点击download blast 004、点击如下链接: 005、点击下载linux 64位: 下载链接:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 006、下载完成后,上传至linux系统 007、解压并进入命令目录 tar -xzvf ncbi-blast-2.14.0+-x64-linux.tar.gz cd ncbi-b...
blast创建数据库的命令:makeblastbd(该命令的参数可以通过“-help”查看,这很重要!) $>>makeblastdb-helpUSAGEmakeblastdb[-h][-help][-ininput_file][-input_type type]-dbtype molecule_type[-title database_title][-parse_seqids][-hash_index][-mask_data mask_data_files][-mask_id mask_algo_ids...
首先,下载并安装blast工具,然后选择需要安装的Linux发行版和版本,接着指定安装目标磁盘,并确认开始安装。blast会自动下载所选Linux系统的镜像文件并将其安装到目标磁盘上。整个过程只需要几分钟时间,非常快捷和便利。 使用sudo blast来安装Linux系统不仅简单方便,而且效率高,特别适合那些希望快速搭建Linux系统的用户。借助su...
准备工具: blast最新的源码包:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 选择适合自己系统的源码包,这里选择“ncbi-blast-2.13.0+-src.tar.gz ” 解压并进入源码路径 tar-xzvf ncbi-blast-2.13.0+-src.tar.gzcdncbi-blast-2.13.0+-src/c++/ 配置编译参数,可以使用configure --help ...
一:安装blast 1. 下载blast: $wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.9.0+-x64-linux.tar.gz 2. 解压: $tar zxvf ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz 3. 将blast添加进环境 $vim ~/.bashrc
linux安装本地blast 1)wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.8.0alpha/ncbi-blast-2.8.0-alpha+-x64-linux.tar.gz 2)tar -zxvf ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz 3)mv ncbi-blast-2.8.0+/ blast 4)echo 'PATH=/home/jxdong/biosoft/blast/bin:$PATH' >> ~/.ba...
1.下载安装linux版本 wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.9.0/ncbi-blast-2.9.0+-x64-linux.tar.gz tar -xzvf ncbi-blast-2.9.0+-x64-linux.tar.gz cd ncbi-blast-2.9.0+/ ./bin/blastp -h 2.使用 先用之前先建库,再比对 ...
一、下载Blast安装包 到Blast的官网(https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/)下载你系统对应的安装包,为了防止文件下载出错,你还可以下载对应的MD5文件进行校验。这里我们下载linux版本的(ncbi-blast-2.10.0+-x64-linux.tar.gz)。下载速度看你网速,可以考虑去弄杯咖啡喝(*^_^*) ...
blastnlinux命令是一种在Linux系统中执行BLASTn程序的命令。BLASTn是一种常用的生物信息学工具,用于在生物序列数据库中搜索相似序列。下面是blastnlinux命令的用法和一些常见参数的解释: 1. 安装BLASTn程序:在Linux系统中安装BLASTn程序可以通过包管理器进行安装,例如使用apt-get命令:sudo apt-get install ncbi-blast...
1. 安装NCBI BLAST+软件包:可以通过包管理器直接安装,例如在Ubuntu上可以使用以下命令: “`shell sudo apt-get install ncbi-blast+ “` 2. 准备输入文件:BLAST命令需要输入一个查询序列文件和一个数据库文件。查询序列文件可以是一个文本文件,其中包含待比对的序列(可以是DNA序列或蛋白质序列),数据库文件可以是...