目录 收起 1.下载安装linux版本 2.使用 3.参数 4.参考 blast安装包网址:Index of /blast/executables/blast+ 我安装的是2.9.0版本 1.下载安装linux版本 wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.9.0/ncbi-blast-2.9.0+-x64-linux.tar.gz tar -xzvf ncbi-blast-2.9.0+-x...
001、进入ncbi官网 002、点击blast 0 003、点击download blast 004、点击如下链接: 005、点击下载linux 64位: 下载链接:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 006、下载完成后,上传至linux系统 007、解压并进入命令目录 tar -xzvf ncbi-blast-2.14.0+-x64-linux.tar.gz cd ncbi-b...
键盘上按住win+R键输入cmd打开命令行,输入下述指令打印blastp文档 blastp -h 出现下面情况表示blast安装成功。 2.2 linux安装blast Linux演示的版本是Ubuntu18.04 在之前的下载页面(如下)下载对应linux版本的blast https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 选择红框处的linux版本下载。 在linu...
一、 linux 安装BLAST linux下的blast是一系列工具集合,包括:blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等。 采用conda安装,可能出现网络连接超时等问题,重复尝试: # 安装blast$>>conda install-c bioconda blast# blast安装perl模块的方法$>>conda install perl-digest-md5 二、 BLAST使用方法 第(1)步:makebla...
准备工具: blast最新的源码包:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 选择适合自己系统的源码包,这里选择“ncbi-blast-2.13.0+-src.tar.gz ” 解压并进入源码路径 tar-xzvf ncbi-blast-2.13.0+-src.tar.gzcd ncbi-blast-2.13.0+-src/c++/ ...
使用sudo blast来安装Linux系统不仅简单方便,而且效率高,特别适合那些希望快速搭建Linux系统的用户。借助sudo命令,用户可以在终端中以超级用户权限来执行blast安装命令,确保在安装过程中不会出现权限不足的问题。通过sudo blast安装Linux系统,用户可以轻松创建自己的开发环境、服务器环境或者虚拟机环境,满足各种需求。
blastnlinux是一个用于在Linux操作系统上运行的BLASTN命令。BLASTN是基于序列比对的算法,用于在DNA或RNA序列数据库中寻找相似序列。 1. 安装BLASTN:在Linux上使用blastn命令之前,首先需要安装BLASTN软件包。可以从NCBI(国家生物技术信息中心)的网站上下载最新的BLASTN软件包,并按照安装说明进行安装。
阿里云服务器--Linux搭建blast本地版 环境 阿里云ECS服务器 系统:Ubuntu 20.04 下载blast代码 官网链接 https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 截图如下 下载界面 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 选择LInux系统,如图所示...
第一步:安装BLAST 在Linux系统中,BLAST有如下几个版本可供选择:BLAST+和NCBI BLAST。BLAST+是由NCBI提供的较新版本,拥有更多的功能和改进的性能。NCBI BLAST是由NCBI提供的经典版本。在本文中,我们将介绍如何安装BLAST+。 1.打开终端并使用sudo su命令切换到超级用户模式。 sudo su 2.更新软件包列表。 apt-get ...