1、把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下; --- 目的:所有用户,不管其当前路径是什么,均可以在命令行下直接调用blast包中的程序,而无需指定该程序的路径 解释:系统的PATH环境变量中包含/usr/local/bin,在命令行下调用blast包中的程序时,系统会去/usr/local/bin路径下寻找相应的...
2.3.7利用winscp软件将blast文件夹中bin目录下的文件全部拷贝至/usr/local/bin下 2.3.8利用putty软件在自己建立的XX文件夹中制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/XX下 #ln-s /home/xx/blast/bin 2.3.9利用winscp软件直接在当前目录(blast文件夹)下,建立.bashrc文件(注意文件名称前有个.),在文件...
然后命令行输入 wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.12.0+-x64-linux.tar.gz 然后解压 tar -zxvf ncbi-blast-2.12.0+-x64-linux.tar.gz 得到解压之后的文件夹,发现文件夹名字太长了,改一下文件名 mv ncbi-blast-2.12.0+ blast+ 进入blast+ 文件夹里面的...
1. 下载软件BLAST: 在以下网址ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 下载: ncbi-blast-2.2.29+-x64-linux.tar.gz (根据自己的操作系统选择)。 2. 解压: 解压后放在任意目录下都可以,把相应路径加入PATH变量就是。 比如解压到用户的主目录(/home/yonpen)下,把解压后的文件夹重新...
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Linux下BLAST的使用---转载 2016-09-27 17:23 −... 原生態 0 2701 PSI-BLAST|PHI-BLAST|UniProt|IGV|Galaxy|clustalx 2019-12-25 15:29 −生物信息学软件: NCBI:BLAST,设定k-mer 默认是全局比对,Blastn是局部比对。 PSI-BLAST最灵敏的BLAST,选中部分矩阵后在数据库中查找相应蛋白。 PHI-BLAST找氨基...
Linux下BLAST的使用 1、把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下; 2、制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /home/username/blast/bin; 3、在当前用户目录下,编辑bashrc文件,在文件中加入export PATH=/home/username/bin/=$PATH;...