1.GC-MS和LC-MS分析幼虫的生物活性研究 通过GC-MS非靶向代谢组学和LC-MS非靶向代谢组学分析代谢物谱发现，如图1a所示，就发育持续时间而言，实验（Tr）组的9.59±0.27天显着长于对照组（CK）组的8.23±0.11天（P <0.01）。如图1b所示，就生存率而言，Tr组的19.78±1.5％显着低于CK组的88.56±1...
代谢组学是继基因组学和蛋白组学之后发展起来的一门组学学科,非靶向代谢组学是无偏向性对所有小分子代谢物(相对质量小于1500)同时进行检测分析的代谢组学。 LC-MS是指液相色谱-质谱联用技术,该技术对待测组分的挥发性和热稳定性没有要求,不需要繁琐的衍生化步骤,样品前处理简单,检测温度低,分离物质快速、高效,是...
摘要:目的研究进展期白癜风患者与健康人血清中的差异代谢物.方法招募进展期白癜风患者59例和健康对照58例.采用高效液相色谱——质谱联用仪器检测非靶向血清代谢物.经主成分分析,偏小二乘法判别分析等方法筛选相关差异生物标志物,利用KEGG数据库对筛选的差异代谢物进行注释和通路富集.结果在进展期白癜风患者以及健康对照的...
2.2代谢组学实验结果稳定性分析经LC-MS质谱分析和QC矫正后,对进展期白癜风患者和健康对照者血液样本间的正负离子模式分别进行PCA和OPLS-DA分析,结果显示,无监督PCA模型下分离趋势不明显(图1a~1b),经过监督的OPLS-DA模型显示较好的分离效果(图1c~1d);200次置换检验(permutationtest)提示实验结果稳定,可重复性好(图...
非靶向代谢组学(Untargeted Metabolomics)主要是利用色谱-质谱联用技术,结合自建数据库或公共数据库对样本中代谢物进行搜库定性和相对定量的代谢组学方法,具有高通量、广覆盖的特点。主要研究思路针对对照组和处理组中检测到的代谢物通过单维和多维统计方法筛选出差异代谢物,再进行代谢通路分析进而阐明机体的作用机制,或筛...
通过GC-MS非靶向代谢组学和LC-MS非靶向代谢组学分析代谢物谱发现,如图1a所示,就发育持续时间而言,实验(Tr)组的9.59±0.27天显着长于对照组(CK)组的8.23±0.11天(P <0.01)。如图1b所示,就生存率而言,Tr组的19.78±1.5%显着低于CK组的88.56±1.4%(P <0.001)。如图1c所示,Tr组的weight重量0.084±0.007 mg...
非靶向LC-MS代谢组学的分析流程 LC-MS非靶向代谢组学的原始下机数据得到的质谱图,将原始数据表达量导入QI软件获得定性定量结果,针对定性结果来做QC样本质控评判仪器的稳定性。 图| 非靶向LC-MS代谢组学分析流程 定性结果表格解析 QI软件定性后的结果为CSV格式,其中LC-MS下机是有正负离子两套数据. ...
本次课程主题为《基于LC-MS的非靶向代谢组学》,主要分为代谢组学简介、代谢组学技术简介、非靶向代谢组学方法和数据采集、非靶向代谢组学数据分析和代谢物结构鉴定几个方面。 一、代谢组简介 基因组学——What ca…
研究人员运用LC-MS非靶向代谢组学技术检测小鼠模型组的血浆代谢组学成分。分析数据发现,与对照组相比,糖尿病模型组的血甘油三酯(TG)、胆固醇、血脂分子升高,但在A10-FMT和Con-FMT组中降低。血浆代谢组数据显示,多不饱和脂肪酸(PUFA)和二十碳五烯酸(EPA)在模型组中较低,而在A10-FMT组中则较高。
本次课程主题为《基于LC-MS的非靶向代谢组学》,主要分为代谢组学简介、代谢组学技术简介、非靶向代谢组学方法和数据采集、非靶向代谢组学数据分析和代谢物结构鉴定几个方面。 一、代谢组简介 基因组学——What can happen;转录组学——What appears to be happening;蛋白组学——What make it happen;代谢组学—...