3. 离心10 min(13000 rpm ,4℃),取150 μL上清液装入带有支脚内衬管的LC-MS进样小瓶中进行分析; 4. 质控样本(QC)由所有样本的提取液等体积混合制备而成,QC的体积与样本相同。 B 生物学重复数 动物样本:6-8次以上生物学重复 菌体/菌液:6-8次以上生物学重复 临床样本:30次以上生物学重复,罕见病尽量多...
运用组学技术：转录组学、16S 测序、LC-MS非靶向代谢组学 研究背景 接受剖宫产手术的女性可能会患上剖宫产瘢痕憩室 (CSD)。CSD是由于子宫局部切口愈合不良，形成与子宫腔相连的凹陷或空腔，可导致各种近期和远期并发症，之前的研究表明，持续性积液是影响 CSD 女性生育能力的主要因素。2022年08月，中山大学附属第...
本文运用LC-MS非靶向代谢组学+转录组测序+16s rRNA微生物测序等多组学技术,研究了海藻酸寡糖(AOS)+肠道微生物菌群治疗对年轻的男性二型糖尿病生育能力的影响,研究的结果为具有潜在男性不育高风险的T2D青少年的有益肠道微生物群的作用机制提供了新的线索。 研究结果强烈表明有必要探索微生物群粪便移植疗法,以降低在T2...
本文运用LC-MS非靶向代谢组学+转录组测序+16s rRNA微生物测序等多组学技术,研究了海藻酸寡糖(AOS)+肠道微生物菌群治疗对年轻的男性二型糖尿病生育能力的影响,研究的结果为具有潜在男性不育高风险的T2D青少年的有益肠道微生物群的作用机制提供了新的线索。 研究结果强烈表明有必要探索微生物群粪便移植疗法,以降低在T2...
代谢组学是继基因组学和蛋白组学之后发展起来的一门组学学科,非靶向代谢组学是无偏向性对所有小分子代谢物(相对质量小于1500)同时进行检测分析的代谢组学。 LC-MS是指液相色谱-质谱联用技术,该技术对待测组分的挥发性和热稳定性没有要求,不需要繁琐的衍生化步骤,样品前处理简单,检测温度低,分离物质快速、高效,是...
运用组学技术:转录组学、微生物16S、LC-MS非靶向代谢组学 研究背景 2022年10月,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所赵勇、张宏福及其团队运用LC-MS非靶向代谢组学、转录组测序、16s rRNA微生物测序等多组学技术,发现海藻酸寡糖(AOS)+肠道微生物菌群治疗的方式可以改善年轻糖尿病患者的精子活力。 本研究中,作者通过模仿...
非靶向代谢组学(Untargeted Metabolomics)主要是利用色谱-质谱联用技术,结合自建数据库或公共数据库对样本中代谢物进行搜库定性和相对定量的代谢组学方法,具有高通量、广覆盖的特点。主要研究思路针对对照组和处理组中检测到的代谢物通过单维和多维统计方法筛选出差异代谢物,再进行代谢通路分析进而阐明机体的作用机制,或筛...
为了找寻更多的差异性代谢物,本实验扩大样本量,选用总体灵敏度更高的血清样本,利用液相色谱-质谱(liquidchromatographmassspectrometer,LC-MS)结合非靶向代谢组学技术分析进展期白癜风患者与健康对照间的血清代谢组学特征,筛选出更多的差异性代谢物及代谢通路,试图为白癜风的诊疗提供新的研究方向。
通过GC-MS非靶向代谢组学和LC-MS非靶向代谢组学分析代谢物谱发现，如图1a所示，就发育持续时间而言，实验（Tr）组的9.59±0.27天显着长于对照组（CK）组的8.23±0.11天（P <0.01）。如图1b所示，就生存率而言，Tr组的19.78±1.5％显着低于CK组的88.56±1.4％（P <0.001）。如图1c所示，Tr组...
本次课程主题为《基于LC-MS的非靶向代谢组学》,主要分为代谢组学简介、代谢组学技术简介、非靶向代谢组学方法和数据采集、非靶向代谢组学数据分析和代谢物结构鉴定几个方面。 一、代谢组简介 基因组学——What can happen;转录组学——What appears to be happening;蛋白组学——What make it happen;代谢组学—...