代谢组学是继基因组学和蛋白组学之后发展起来的一门组学学科,非靶向代谢组学是无偏向性对所有小分子代谢物(相对质量小于1500)同时进行检测分析的代谢组学。 LC-MS是指液相色谱-质谱联用技术,该技术对待测组分的挥发性和热稳定性没有要求,不需要繁琐的衍生化步骤,样品前处理简单,检测温度低,分离物质快速、高效,是...
2.2代谢组学实验结果稳定性分析经LC-MS质谱分析和QC矫正后,对进展期白癜风患者和健康对照者血液样本间的正负离子模式分别进行PCA和OPLS-DA分析,结果显示,无监督PCA模型下分离趋势不明显(图1a~1b),经过监督的OPLS-DA模型显示较好的分离效果(图1c~1d);200次置换检验(permutationtest)提示实验结果稳定,可重复性好(图...
1.GC-MS和LC-MS分析幼虫的生物活性研究 通过GC-MS非靶向代谢组学和LC-MS非靶向代谢组学分析代谢物谱发现,如图1a所示,就发育持续时间而言,实验(Tr)组的9.59±0.27天显着长于对照组(CK)组的8.23±0.11天(P <0.01)。如图1b所示,就生存率而言,Tr组的19.78±1.5%显着低于CK组的88.56±1.4%(P <0.001)。如图...
1.GC-MS和LC-MS分析幼虫的生物活性研究 通过GC-MS非靶向代谢组学和LC-MS非靶向代谢组学分析代谢物谱发现,如图1a所示,就发育持续时间而言,实验(Tr)组的9.59±0.27天显着长于对照组(CK)组的8.23±0.11天(P <0.01)。如图1b所示,就生存率而言,Tr组的19.78±1.5%显着低于CK组的88.56±1.4%(P <0.001)。如图...
非靶向LC-MS代谢组学的分析流程 LC-MS非靶向代谢组学的原始下机数据得到的质谱图,将原始数据表达量导入QI软件获得定性定量结果,针对定性结果来做QC样本质控评判仪器的稳定性。 图| 非靶向LC-MS代谢组学分析流程 定性结果表格解析 QI软件定性后的结果为CSV格式,其中LC-MS下机是有正负离子两套数据. ...
本次课程主题为《基于LC-MS的非靶向代谢组学》,主要分为代谢组学简介、代谢组学技术简介、非靶向代谢组学方法和数据采集、非靶向代谢组学数据分析和代谢物结构鉴定几个方面。 一、代谢组简介 基因组学——What can happen;转录组学——What appears to be happening;蛋白组学——What make it happen;代谢组学—...
1.基于LC-MS非靶向代谢组定性结果的多元统计分析 对于ER / TR，ER / MR和TR / MR三个比较组，作者分别使用PCA，PLS-DA和OPLS-DA绘制得分图，并构建了OPLS DA模型的验证图（图1），模型参数汇总在表1中。（a）TR / ER比较组的PLS-DA；（b）TR / ER比较组的OPLS-DA；（c）TR / ER比较组的OPLS-DA...
本次课程主题为《基于LC-MS的非靶向代谢组学》,主要分为代谢组学简介、代谢组学技术简介、非靶向代谢组学方法和数据采集、非靶向代谢组学数据分析和代谢物结构鉴定几个方面。 一、代谢组简介 基因组学——What can happen;转录组学——What appears to be happening;蛋白组学——What make it happen;代谢组学—...
LC-MS非靶向代谢组学—非靶向代谢物检测技术培训服务 1、 实验简介 非靶向代谢组学是通过液质联用(LC–MS)方法检测生物体受扰动或刺激前后代谢产物的动态变化,从中找出表达差异的代谢物,进而阐明生物体代谢相关过程的代谢组学技术。 2、 实验样品类型 序号样品类型推荐送样量1常规组织≥ 200mg2粪便≥ 200mg3植物...
非靶向代谢组学(Untargeted Metabolomics)主要是利用色谱-质谱联用技术,结合自建数据库或公共数据库对样本中代谢物进行搜库定性和相对定量的代谢组学方法,具有高通量、广覆盖的特点。主要研究思路针对对照组和处理组中检测到的代谢物通过单维和多维统计方法筛选出差异代谢物,再进行代谢通路分析进而阐明机体的作用机制,或筛...