4.功能分析:"万里长征" 的最后一步,把结果解析好是代谢组的点睛之笔。然而要将功能注释做得尽善尽美,通常还需要结合文献调研与后续实验来确认。不过我们可以先通过通路鉴定,GESA 分析,通路富集分析,网络分析等分析方法找到关键代谢通路与代谢物作为功能分析的切入点。 图3. 代谢组学数据分析流程[6] 典型的代谢组...
2021年11月,宁波大学海洋科学学院王春琳团队在Frontiers in Marine Science期刊发表了题为“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,发现了氨基酸和能量代谢是参与青蟹适应盐度变化的主要因素,而脂质代谢物起辅助作用。
从分类可以发现,显著代谢途径和非显著途径均主要与氨基酸、信号转导和能量代谢有关。 图5 | 青蟹鳃组织中适应低盐度的代谢途径分析 饼图分类:显著富集(A)和非显著富集(B);青蟹适应低盐度的前 20 种代谢途径的代谢组视图图(C)。 通过GC-MS/LC-MS 进行相关性分析 为了更全面地揭示青蟹对低盐度的适应代谢机制,...
代谢组学是继基因组学和蛋白组学之后发展起来的一门组学学科,非靶向代谢组学是无偏向性对所有小分子代谢物(相对质量小于1500)同时进行检测分析的代谢组学。 LC-MS是指液相色谱-质谱联用技术,该技术对待测组分的挥发性和热稳定性没有要求,不需要繁琐的衍生化步骤,样品前处理简单,检测温度低,分离物质快速、高效,是...
文章通过研究小鼠甲状腺毒症与衰老的关系,采用LC-MS、GC-MS非靶代谢组学及DIA蛋白质组学结合的方法,分析内源性代谢组和血清蛋白质组的变化。为甲状腺毒症小鼠衰老模型的建立及探索抗衰老药物研发提供新思路。 2022年06月,鲁南制药集团...
非靶向代谢组学(Untargeted Metabolomics)主要是利用色谱-质谱联用技术,结合自建数据库或公共数据库对样本中代谢物进行搜库定性和相对定量的代谢组学方法,具有高通量、广覆盖的特点。主要研究思路针对对照组和处理组中检测到的代谢物通过单维和多维统计方法筛选出差异代谢物,再进行代谢通路分析进而阐明机体的作用机制,或筛...
非靶向代谢组学是通过液质联用(LC–MS)方法检测生物体受扰动或刺激前后代谢产物的动态变化,从中找出表达差异的代谢物,进而阐明生物体代谢相关过程的代谢组学技术。 2、 实验样品类型 序号样品类型推荐送样量1常规组织≥ 200mg2粪便≥ 200mg3植物样品≥ 200mg4细胞样品≥5×10^65血浆、血清≥200ul6尿液≥1mL7培...
通过GC-MS非靶向代谢组学和LC-MS非靶向代谢组学分析代谢物谱发现，如图1a所示，就发育持续时间而言，实验（Tr）组的9.59±0.27天显着长于对照组（CK）组的8.23±0.11天（P <0.01）。如图1b所示，就生存率而言，Tr组的19.78±1.5％显着低于CK组的88.56±1.4％（P <0.001）。如图1c所示，Tr组...
本次课程主题为《基于LC-MS的非靶向代谢组学》,主要分为代谢组学简介、代谢组学技术简介、非靶向代谢组学方法和数据采集、非靶向代谢组学数据分析和代谢物结构鉴定几个方面。 一、代谢组简介 基因组学——What can happen;转录组学——What appears to be happening;蛋白组学——What make it happen;代谢组学—...
本次课程主题为《基于LC-MS的非靶向代谢组学》,主要分为代谢组学简介、代谢组学技术简介、非靶向代谢组学方法和数据采集、非靶向代谢组学数据分析和代谢物结构鉴定几个方面。 一、代谢组简介 基因组学——What ca…