LC-MS非靶代谢组学的技术路线包括实验检测和数据分析两大部分,其中实验部分包括样本收集、代谢物提取、代谢物检测,数据分析包括原始数据的处理、数据质控、数据评估、统计分析。统计分析通过单变量统计分析和多变量统计分析方法,筛选出组间差异的代谢物,然后对其代谢通路进行分析。图2 LC-MS非靶向代谢组学检测技术路...
其中LC-MS非靶向代谢组学是一种利用液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)无偏向性地检测生物体内所有小分子代谢物的动态变化的技术。由于环境对生物体的影响会最终体现为代谢物的变化,因此LC-MS非靶向代谢组学在动物生长发育、疾病生物标志物(Biomarker)筛选、药物研发等领域的应用越来越广泛。 一、原理简介 LC-MS非靶...
最初由英国Jeremy Nicholson教授提出,是研究生命体对外界刺激,病理生理变化等因素引起的代谢产物种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学的技术平台主要分为NMR, LC-MS和GC-MS。LC-MS适合检测大部分代谢物,技术成熟稳定,是研究代谢变化的主流技术。 三黍生物基于超高效液相色谱-串联轨道肼质谱(UHPLC-QE)对样本中的...
通过液质联用(LC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有显著变化的代谢物,进而研究这些代谢物与生理病理变化的相关关系,其研究对象大多是分子量1500Da以内的小分子物质。 技术优势 较高的灵敏度、分辨率; 较...
(LA0716或PI246502)和现代栽培番茄品种M82构建的遗传群体为研究对象,运用转录组学+LC-MS非靶向代谢组学确定了与数百种转录物和代谢物水平相关的基因组位点,对促进类黄酮在果实果皮组织中积累的相关位点和基因进行了分析,为理解番茄果实成熟过程中的代谢和病原菌抗性提供了遗传框架,并为研究关键果实品质性状提供了依据...
主要运用生物技术:LC-MS非靶向代谢组学(由上海鹿明生物科技有限公司提供技术支持)文章背景 地黄是中医学重要的多年生草本植物,其根部富含生物活性化合物,可用于发烧、神经疾病、糖尿病和高血压的治疗,也有增强肝功能、增强造血功能和免疫防御的功效。近年来多层组学整合研究方法已被应用到地黄研究中,可更好地了解...
本次课程主题为《基于LC-MS的非靶向代谢组学》,主要分为代谢组学简介、代谢组学技术简介、非靶向代谢组学方法和数据采集、非靶向代谢组学数据分析和代谢物结构鉴定几个方面。 一、代谢组简介 基因组学——What can happen;转录组学——What appears to be happening;蛋白组学——What make it happen;代谢组学...
本次课程主题为《基于LC-MS的非靶向代谢组学》,主要分为代谢组学简介、代谢组学技术简介、非靶向代谢组学方法和数据采集、非靶向代谢组学数据分析和代谢物结构鉴定几个方面。 一、代谢组简介 基因组学——What can happen;转录组学——What appears to be happening;蛋白组学——What make it happen;代谢组学...
Chronic Inflammation of Crohn's Disease ”的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,发现了炎症肠系膜脂肪细胞和巨噬细胞表型转化中有效调的节的细胞因子:FADS2,探究了肠系膜脂肪细胞的代谢谱以及在CD背景下关键代谢变化与局部炎症之间的相关性,描绘了肠系膜脂肪细胞的代谢谱,为治疗慢性炎症性的克罗恩病提供了...
本次课程主题为《基于LC-MS的非靶向代谢组学》,主要分为代谢组学简介、代谢组学技术简介、非靶向代谢组学方法和数据采集、非靶向代谢组学数据分析和代谢物结构鉴定几个方面。 一、代谢组简介 基因组学——What can happen;转录组学——What appears to be happening;蛋白组学——What make it happen;代谢组学...