在lammps模拟中,所有的键默认是永久存在的,非正常情况下,不能断开,否则会产生"bond atoms missing”错误。 聚合物的拉伸模拟过程中,聚合物链并没有被拉断,而只是把不同的聚合物链分离。 如果要模拟拉伸过程中键的断裂,就需要加一个额外的命令:fix bond/break。 fix 5 all bond/break 10 2 1.2 fix 5 polyme...
这样做就好像是在定义这个新的fix命令之前,先使用unfix命令取消了旧fix命令,除了说它们所作用的顺序会因着定义的位置不同而有所差异。另外需要注意的是,这种重新定义fix命令也会将先前使用fix_modify命令定义的,与旧fix命令相关的其他任何改变都清除掉。 fix_modify命令可以用来重置fix命令定义的某些设置。具体细节可以...
fix 13 bond4 bond/create 1 2 4 3.0 1 prob 1. 1423 fix 14 bond4 bond/break 1 1 3.0 prob 1. 143 fix 15 bond5 bond/create 1 2 5 3.0 1 prob 1. 1423 fix 16 bond5 bond/break 1 1 3.0 prob 1. 143 fix 17 bond6 bond/create 1 2 6 3.0 1 prob 1. 1423 fix 18 bond6 bond...
这样做就好像是在定义这个新的fix命令之前,先使用unfix命令取消了旧fix命令,除了说它们所作用的顺序会因着定义的位置不同而有所差异。另外需要注意的是,这种重新定义fix命令也会将先前使用fix_modify命令定义的,与旧fix命令相关的其他任何改变都清除掉。 fix_modify命令可以用来重置fix命令定义的某些设置。具体细节可以...
采用fix bond..请教一下各位吧友,我测试聚乙烯共价键断裂时产生能量过大(5900步时发生断裂),应该怎么解决呢。太容易程序崩溃了。还有就是势能按理说应该减少啊,反而短暂大幅度增加然后衰减这是为什么呢?这是为什么呢?
所以我在lammps命令上找到了bond/swap命令，该命令的描述确实符合这种玻璃化过程。
使用fixbond/break命令的时候需要MC软件包进入src文件中用makeyes-MC然后mpi显示是安装上了但是fixbond/break任然无法运行,显示Unknownfixstyle有遇到过这个问题吗求大神指导怎么解决? 分子模拟 LAMMPS/DL_POLY
:doc:`fix bond/create <fix_bond_create>`, :doc:`fix bond/break <fix_bond_break>`, Expand Down 1 change: 1 addition & 0 deletions 1 examples/PACKAGES/electrode/madelung/.gitignore Show comments View file Edit file Delete file This file contains bidirectional Unicode text that may be...
fix_ave_histo_weight.cpp fix_ave_histo_weight.h fix_ave_time.cpp fix_ave_time.h fix_aveforce.cpp fix_aveforce.h fix_balance.cpp fix_balance.h fix_bond_history.cpp fix_bond_history.h fix_box_relax.cpp fix_box_relax.h fix_deform.cpp fix_deform.h fix_deposit.cpp fix_deposit.h fix...
1 LAMMPS 简要使用说明简要使用说明 目录目录 lammps 简要使用说明简要使用说明 1 LAMMPS 介绍 . 4 文件 4 1. 系统初始化. 4 units lj/real/metal/si/cgs 4 atom_style angle/atomic/bond/charge/dipole/dpd/ellipsoid/full/granular/molecular/hybrid 5 atom_modify map/first 5 dimension N ,N=2/3 5 bo...