lammps自带delete_atoms可以随机删除一定比例的原子,如果对孔隙或空位的形状、尺寸等有特殊需求,需要用编程的方法删除原子。 delete_atoms porosity命令可随时产生设定比例的原子,如删除50%的原子: 代码语言:javascript 代码运行次数:0 复制 Cloud Studio代码运行 delete_atoms porosity membrane0.5482793 membrane为原子组 0....
孔隙或空位缺陷的建模原理比较简单:删除一定数量的原子就可以。 lammps自带delete_atoms可以随机删除一定比例的原子,如果对孔隙或空位的形状、尺寸等有特殊需求,需要用编程的方法删除原子。 delete_atoms porosity命令可随时产生设定比例的原子,如删除50%的原子: delete_atomsporositymembrane0.5482793 membrane为原子组 0.5为...
delete_atomsoverlapargs=cutoffgroup1-IDgroup2-ID group1-ID、group2-ID为两个原子组,cutoff确定原子间距,间距在cutoff内并且分别处于两个组内的原子之一(group1-ID组)会被删除。 如: delete_atomsoverlap0.3group1group2 3. 随机删除原子 按照一定比例随机删除原子,比如随机产生空位,语法为: delete_atomsporosit...
孔隙或空位缺陷的建模原理比较简单:删除一定数量的原子就可以。 lammps自带delete_atoms可以随机删除一定比例的原子,如果对孔隙或空位的形状、尺寸等有特殊需求,需要用编程的方法删除原子。 delete_atoms porosity命令可随时产生设定比例的原子,如删除50%的原子: delete_atomsporositymembrane0.5482793 1. membrane为原子组 0...
delete_atoms porosity cube 0.1 482793 1. 4. 删除分子 分子含有多个原子,如果仅删除一个原子,如H2O仅删除一个H或者一个O原子,在模拟的时候可能会报错。 这时候就需要删除整个H2O分子,加上关键字mol即可。 delete_atoms overlap 0.5 Water Cu mol yes ...
delete_atoms porosity region-ID fraction seed 这里region-ID是包含要删除原子的区域ID,fraction是删除原子的比例,seed是随机数种子。 3. 压缩原子ID(可选) 在删除原子后,原子ID可能会变得不连续。如果你需要连续的原子ID(例如,在使用某些命令时),你可以使用compress yes选项来重新编号剩余的原子: lammps delete...
delete_atoms group edge delete_atoms region sphere compress no delete_atoms overlap 0.3 all all delete_atoms overlap 0.5 solvent colloid delete_atoms porosity cube 0.1 482793 bond yes 说明 该命令主要用于删除不需要的原子。可用于创建晶界,缺陷,多孔孔结构。
7 delete_atoms group/region/overlap/porosity args . 7 read_restart file/read_date file. 7 set atom/group/region ID keyword values . 8 displace_atoms groupID move/ramp/random args keyword 4、 value . 8 displace_box groupID parameter args . keyword value . 8 change_box ortho/triclinic ....
delete_atoms group/region/overlap/porosity args (7)read_restart file/read_date file (7)set atom/group/region ID keyword values (8)displace_atoms g roup−ID move/ramp/random args keyword value (8)displace_box group−ID parameter args ... keyword value .. (8)change_box ortho/triclinic ...
create_atoms type box/region/single args keyword values . 7 delete_atoms group/region/overlap/porosity args . 7 read_restart file/read_date file. 7 set atom/group/region ID keyword values 8 displace_atoms groupID move/ramp/random args keyword value . 8 displace_box groupID parameter args ...