(4)模拟步长设置不合理 当以上原因都排除后,如果还是存在“lost atoms”,考虑是否是timestep设置过大,设置更小的步长试试。 当出现丢失原子错误提示时,添加thermo_modify lost ignore 命令可以关掉错误提示,使程序能够运行下去。 但是,不建议这么做,这个命令仅仅是强制程序继续运行,不能解决原子丢失问题,程序“带病”...
(4)模拟步长设置不合理 当以上原因都排除后,如果还是存在“lost atoms”,考虑是否是timestep设置过大,设置更小的步长试试。 当出现丢失原子错误提示时,添加thermo_modify lost ignore 命令可以关掉错误提示,使程序能够运行下去。 但是,不建议这么做,这个命令仅仅是强制程序继续运行,不能解决原子丢失问题,程序“带病”...
最后，值得注意的是，LAMMPS官方文档提到，在使用thermo_modify lost ignore flush yes时，如果仍有损失原子的错误，可能需要深入检查和调整具体设置。查阅官方论坛lammps.sandia.gov/threads/...，可能会找到更多有用的解决方案。
3)thermo_modify command, to ignore the lost atoms, but unfortunately, the model has totally goes to a unexpected shape, this may not a good choice when there are too many atoms will lost. 4) change the parameters to revise the model, this works because it can reduce the possibility of ...
thermo_modify lost ignore dump 1 all atom 1000 relax.lammpstrj run 10000 unfix 2 undump 1 reset_timestep 0 #--- 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 设置输出参量,在nvt下对石墨烯进行单轴拉伸 #---8 拉伸设置--- thermo...
box #删除飞出box外的原子 thermo_modify lost ignore flush yes run 100000 公众号：lammps加油站 ...
#---7 结构弛豫---fix 1 boundary setforce 0 0 0fix 2 all npt temp 300 300 0.01 iso 0 0 0.1thermo 1000thermo_modify lost ignoredump 1 all atom 1000 relax.lammpstrjrun 10000unfix 2undump 1reset_timestep 0#--- 设置输出参量,在nvt下对石墨烯进行单轴拉伸 #---8 拉伸设置---thermo_sty...
thermo_modify lost ignore unfix 1 #注入热量 fix 2 all nve fix hot all heat 10 10...
#---7 结构弛豫---fix 1 boundary setforce 0 0 0fix 2 all npt temp 300 300 0.01 iso 0 0 0.1thermo 1000thermo_modify lost ignoredump 1 all atom 1000 relax.lammpstrjrun 10000unfix 2undump 1reset_timestep 0#--- 设置输出参量,在nvt下对石墨烯进行单轴拉伸 #---8 拉伸设置---thermo_sty...
应该用hybrid，而不是单独列出每一个 此外，多少种原子类型，tersoff后面则需要出现对应数目的参数。