第三种可能,在使用reaxff势时使用了lgvdw yes,该长程作用力在读取势文件时需要引入某些特定参数值(这在一般的势函数文件中是没有的),还需要在参数表中更改参数,仅在使用reaxff-lg势函数时才能打开,应关闭(不写默认关闭)。 3. Unknown identifier in data file 当LAMMPS在读取数据文件时遇到意外格式的一行文本时...
data文件如下：LAMMPS data file. CGCMM style. atom_style full generated by VMD/TopoTools v1.5 ...
与dump文件一样,restart不能包含两个wild card characters(即通配符)。若filename中含有*号,则它会被目前的值所代替(该情况只在仅有一个filename的情况下成立) 1 之后这些binary files可通过指令read-restart来读出 在此我们给出2条程序,用于读出binary restart file 或者是converted data file,之后发出一条新的运...
210 E: Cannot open dump file 211 git-svn-id: svn://svn.icms.temple.edu/lammps-ro/trunk@14602 f3b2605a-… 6 years ago 212 Self-explanatory. git-svn-id: svn://svn.icms.temple.edu/lammps-ro/trunk@7374 f3b2605a-c… 10 years ago 213 214 E: Illegal ... command 215 216 ...
丶心语丨 初级粉丝 1 请问安装好了之后在哪里找到运行文件呢 起名好纠结3 中级粉丝 2 楼主你好,我是新手,我在运行的时候出现了error:cannot open dump file怎么回事 贴吧用户_Qb7NQ3G 初级粉丝 1 楼主你好,我install lammps-daily,cd 切换时 却提示我没有文件或目录 登录...
I then switched to reading thelammps.dumpwithase.io.readand write each structure in anextxyzfile including the velocities, like this traj=ase.io.read('path/to/lammps.dump',index=':')withopen('traj.xyz','w')asf:forsintraj:s.symbols[:]='Al's.write(f,format='extxyz')dynasor.Trajecto...
template=lt.adjust_temp_read(se.lattice,gn+'.struct',gn,athermal=True)withopen('temp.in','w')asf: f.write(template) f.write('\nrun 0 post no\n') lmp=lammps() lmp.file('temp.in') lmp.close() check=run_ovitos('CNA',gn+'.struct',gn+'CNAOUT') ...
void Reader::open_file(const std::string &file) { if (fp != nullptr) close_file();if (platform::has_compress_extension(file)) { compressed = true; fp = platform::compressed_read(file); if (!fp) error->one(FLERR, "Cannot open compressed file for reading");...
bin/lmp: error while loading shared libraries: liblammps.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory 很遗憾,尽管 build 中的lmp 执行没问题,但安装目录中的可执行文件仍然差一点,找不到共享库。如果你当时没选装共享库,那应该链接了静态库,估计能成功运行,因为静态库已经嵌入了可执...
Cannot open EAM potential file Al99.eam.alloy 完全是火 7楼: Originally posted by xyq028565 at 2016-01-04 09:29:47 LZ求问,那个势函数怎么添加啊,我是小白一个我黏贴你的in文件之后输入出现 Cannot open EAM potential file Al99.eam.alloy 网上找一下这个势函数,然后放在计算的文件夹里。我也新手,...