LAMMPS是一种用于分子动力学模拟的软件包,可以模拟原子、分子和颗粒等系统的行为。在LAMMPS模拟中,真空层是指原子模拟系统中的空隙或空气区域,通常是由于实验装置或模拟模型的需要而设置的。 二、LAMMPS中真空层的设置方法 在创建LAMMPS模拟时,所有的原子都处在一个封闭的空间内,这个空间被称为盒子(box)...
第一种方法非常简单,根据LAMMPS官方手册,可以直接采用编译好的可执行文件进行安装。复制以下命令,依次执行,即可获得执行文件lmp_daily: 1)sudo add-apt-repository ppa:gladky-anton/lammps 2)sudo apt-get update 3)sudo apt-get install lammps-daily 4)cd /lammps/examples/HEAT(打开LAMMPS中有关传热的例子) ...
我也用过，测试了好多遍，都是只有输出文件但无输出内容，跟你一样。后来就没用这个命令，直接用的re...
本发明属于化学分子反应动力学领域,公开了一种基于lammps模拟煤与生物质共热解体系中C,H,O元素的标记方法,步骤为:1)提取煤与生物质共热解体系混合模型中煤,生物质分子数据,将数据转换为data格式文件;2)修改煤,生物质分子data格式文件中C,H,O的原子类型序号;3)将混合模型的数据存储为pdb格式文件,并转换为data格式...