最近下载了最新的R版本后,在下载包的时候经常碰到这样的错误:package'***' is not available(for R version 3.4.1) 可使用下面的代码进行安装: source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("包名") 将会下载BiocInstaller包,通过该包可以更好的下载或更新Bioconductor and CRAN packages。
想使用我们云生信团队自己开发的一个软件著作权,首先就是要安装这个gglayer包。于是进行常规安装报错如下: 背景:ubuntu 20.04 ;Bioconductor 3.15 ;R 4.2.0 ; 已安装BiocManager 安装gglayer报错 package ‘gglayer’ is not available for Bioconductor version 3.15 ...
找对repository 有的包不在CRAN里面 安装bioconductor的包,必须 source("https://bioconductor.org/biocLite.R") 否则可能报错: ERROR: compilation failed for package 设置repository的方法 setRepositories() 查看你要的package在不在这个repository里面,以“foobarbaz”为例 ap <- available.packages() "foob...
执行install.packages('BiocManager'),安装BiocManager。 问题:执行BiocManager::install('clusterProfiler'),出现error: 'BiocParallel' did not register default BiocParallelParams: 解决: remove.packages("BiocInstaller") BiocManager::install('BiocParallel') 参考网址中的方法:source("https://bioconductor.org/biocLi...
我的R语言版本是4.0.2,安装graph包的时候出现如下报错 尝试过换源都无法下载 后来尝试在google想搜索graph包的官网,搜出来:https://cran.r-project.org/web/packages/graph/index.html 应该是graph包被CRAN更新了,现在已不在使用 根据它的提示,进入链接:https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/...
当你在R中遇到“package 'annotationdbi' is not available for this version of R”的错误时,这通常意味着annotationdbi包可能不再支持你的R版本,或者该包已经被废弃并替换为其他包。以下是一些解决此问题的步骤: 1. 确认R语言的版本 首先,你需要确认你当前使用的R版本。你可以通过在R控制台运行以下命令来查看:...
install.packages("BiocManager"BiocManager::install("affy"或者 source("https://bioconductor.org/bio...
Hi there, I am trying to install monocle3 on Bioconductor version 3.15 (BiocManager 1.30.18), R 4.2.1 (2022-06-23), but I am getting this error: ERROR: dependency ‘Matrix.utils’ is not available for package ‘monocle3’ And I found Package...
"ERROR: dependency ‘Rsamtools’ is not available for package ‘Signac’ removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.2-arm64/Resources/library/Signac’ Warning messages: 1: In i.p(...) : installation of package ‘Rhtslib’ had non-zero exit status 2: In i.p(...) : installation...
In all eukaryotes, acetylation of histone lysine residues correlates with transcription activation. Whether histone acetylation is a cause or consequence of transcription is debated. One model suggests that transcription promotes the recruitment and/or a