由于m7G-MeRIP-seq和m7G-miCLIP-seq方法不是单碱基的,可能存在误判,因此作者将m7G peak中的G(30 bp滑窗)包含进来,并使用m7Gfinder进一步预测评估其可靠性。 如果想了解你感兴趣的基因是否存在m7G RNA修饰,直接使用m7GHub查询,然后绘制3种方法的venn图。 图3. 三种方法交集 iRNA-m7G预测 同时,为了更进一步的进行...
如果想了解你感兴趣的基因是否存在m7G RNA修饰,直接使用m7GHub查询,然后绘制3种方法的venn图。 图3. 三种方法交集 iRNA-m7G预测 同时,为了更进一步的进行评估,我们可以引入第三方软件iRNA-m7G进行对上述获得的序列进行评估预测。打开iRNA-m7G网站(图4),点击导航栏的“WEB SERVER”,输入待预测序列,提交即可(图5)。
同时,为了更进一步的进行评估,我们可以引入第三方软件iRNA-m7G进行对上述获得的序列进行评估预测。打开iRNA-m7G网站(图4),点击导航栏的“WEB SERVER”,输入待预测序列,提交即可(图5)。同时,可以下载软件到本地进行批量预测。 图4.iRNA-m7G网站 图5. m7G位点预测 预测结果(图6)。score越大表明发生m7G的概率越大。
如果想了解你感兴趣的基因是否存在m7G RNA修饰,直接使用m7GHub查询,然后绘制3种方法的venn图。 图3. 三种方法交集 iRNA-m7G预测 同时,为了更进一步的进行评估,我们可以引入第三方软件iRNA-m7G进行对上述获得的序列进行评估预测。打开iRNA-m7G网站(图4),点击导航栏的“WEB SERVER”,输入待预测序列,提交即可(图5)。