如果想了解你感兴趣的基因是否存在m7G RNA修饰,直接使用m7GHub查询,然后绘制3种方法的venn图。 图3. 三种方法交集 iRNA-m7G预测 同时,为了更进一步的进行评估,我们可以引入第三方软件iRNA-m7G进行对上述获得的序列进行评估预测。打开iRNA-m7G网站(图4),点击导航栏的“WEB SERVER”,输入待预测序列,提交
如果想了解你感兴趣的基因是否存在m7G RNA修饰,直接使用m7GHub查询,然后绘制3种方法的venn图。 图3. 三种方法交集 iRNA-m7G预测 同时,为了更进一步的进行评估,我们可以引入第三方软件iRNA-m7G进行对上述获得的序列进行评估预测。打开iRNA-m7G网站(图4),点击导航栏的“WEB SERVER”,输入待预测序列,提交即可(图5)。
1)m7GDB:实验验证的m7G位点数据库 2)m7GFinder:高准确性预测m7G位点网络服务器 3)m7GSNPer:评估遗传突变对m7G RNA修饰影响 4)m7GDiseaseDB:导致m7G位点获得或者缺失的疾病相关遗传变异数据库 图2. m7GHub数据库 该数据库收集了69159个m7G位点。由于m7G-MeRIP-seq和m7G-miCLIP-seq方法不是单碱基的,可能存在误判...
该数据库收集了69159个m7G位点。由于m7G-MeRIP-seq和m7G-miCLIP-seq方法不是单碱基的,可能存在误判,因此作者将m7G peak中的G(30 bp滑窗)包含进来,并使用m7Gfinder进一步预测评估其可靠性。 如果想了解你感兴趣的基因是否存在m7G RNA修饰,直接使用m7GHub查询,然后绘制3种方法的venn图。 图3. 三种方法交集 iRNA-...