但是不够灵活,如果想要更好的编写利用宏,需要了解更多关于宏的命令和说明,这些可以在官网上找到: https://imagej.nih.gov/ij/developer/macro/macros.html 宏指令开发指南: https://imagej.nih.gov/ij/docs/macro_reference_guide.pdf 最重要的是多尝试、多摸索。遇到那些重复枯燥工作的时候,尝试着利用宏来减轻...
实现效果: 一、安装Stardist 参考之前的这篇文章: 二、Macro recorder记录Stardist (1)打开一张想要处理的图像 这里的数据来自DSB 2018 nuclei segmentation challenge dataset. (2)打开Macro Recorder(Plugins -> Macros -> Record) 不熟悉Macro Recorder,可以参考这篇文章: (3)打开StarDist(Plugins -> StarDist ->...
打开第一张图片:首先,打开你需要处理的第一张图片。 录制宏:点击ImageJ中的Macro-record按钮(如图3所示),开始录制你的操作步骤。 处理图片:接下来,对图片进行各种操作,如滤波或阈值处理。所有这些步骤都会被记录下来。 保存宏:完成操作后,点击Recorder上的Create按钮(如图4所示),保存你录制的宏代码。 批量处理:对...
矩形框随便画,makeRectangle(512, 512, 1024, 1024); 打开ROI manager --more--specify 设置 画的框的尺寸和位置,run("ROI Manager..."); 之后单击 Image -> Crop进行裁切, 可以看到宏命令Record里记录了该条命令,为: Recorder的记录如下: 3. 开启批处理 点击Process -> Batch -> Macro… 开启基于宏命...
ImageJ宏:批量解放双手! 📝 宏(Macro)是ImageJ中的一个强大工具,可以将一系列操作打包成一个命令,实现自动化处理。以下是使用宏进行批量操作的步骤:1️⃣ 打开Plugins > Macros > Record,开始记录你的操作。2️⃣ 加载一张图片,进行你需要的常规操作(每一步都会被记录下来)。
可以看到宏命令Record里记录了该条命令,为: Recorder的记录如下: 3. 开启批处理 点击Process -> Batch -> Macro… 开启基于宏命令的批处理 在弹出的Batch Process中定义好: Input(需要处理的图片们所在的文件夹路径); Output(处理后图片们的存储位置) ...
用imageJ 或 Fiji打开一个图片,从菜单栏选择“Plugins>Macros>Record“。 回到打开的图片,从菜单栏选择"Image>Properties...",修改相素值pixel width, pixel height为1。 此时Macro Record窗口中自动记录下修改相素操作过程对应的代码:run("Properties...", "channels=1 slices=1 frames=1 pixel_width=1 pixel_...
点击菜单Plugins->Macros->Record 执行操作: 打开一张图片 复制一份图片,按Image->Duplicate(或者按Ctrl+Shift+D) 把图片转换成8-bit 每次使用ImageJ菜单中的操作都会成为macro中一条命令 然后点击Create按钮,就打开一个Macro编辑器,里面就是一个Macro。
2、选中想要测量的Channel,Run这个Macro,即可得到4种评分所占面积的百分比: 注意IHC_Profiler里四个评分的定义: High positive (灰度值0-60) Positive (灰度值61-120) Low Positive (灰度值121-180) Negative (灰度值181-236) 1、插件安装 注意:Fiji和IHC Profiler会出现不兼容的情况,导致结果错误,建议在Image...
示例JavaScript程序可在imagej.nih.gov/ij/macros/js/上找到。可以使用Recorder(Plugins>Macros>Record)生成线程安全的JavaScript代码。脚本可以在编辑器中作为任何其他宏打开。扩展名为.js的脚本可以使用Macros>Run Macro 来运行,否则必须使用Macros>Evaluate JavaScript 。