Immunohistochemistry (IHC) Image Analysis Toolbox 界面中有5个按钮,例如训练,读取用户模型,颜色,细胞核和腺体以及保管箱Select_Model。这些函数描述如下。 训练(Training)按钮用于选择和过滤掉不需要的颜色像素(如以下训练过程所示)。 投递箱(Drop box)可以读取系统预定义的模型,例如 H-DAB 颜色检测模型。 读取用户...
点击IHC_Toolbox.jar便可以下载了,下载之后不要解压,直接放在ImageJ安装目录中“Plugins”这个文件夹当中即可。或者打开ImageJ,直接将下载好的IHC Toolbox拖拽到窗口亦可。 注意事项(避坑tips) 1、官网已经明确说了,ImageJ的版本不能低于ImageJ 1.40p,不符合的只能先升级更新一下再安装; 2、网站虽然没有明确说明,...
安装IHC Toolbox时,您可以将下载的IHC_Toolbox.jar拖放到“ImageJ”窗口,或通过“Plugins ->Install”命令下载并安装。工具箱界面包含5个按钮,分别对应于训练、读取用户模型、颜色、细胞核和腺体检测以及模型保存。每个功能的使用方法如下:训练过程:开始训练过程,训练基于视觉选择的颜色像素的统计颜色检...
用户创建的模型和参数可以保存并传输给不同的用户,以便在不同的实验室中重现检测结果。该工具中包含的功能是半自动颜色选择、自动统计颜色检测、自动细胞核分割和自动腺体检测(定位候选腺体的边界框并需要进一步分类,例如支持向量回归 (SVR)。 安装方法 将下载好的IHC_Toolbox.jar拖放到“ImageJ”窗口或使用Plugins->...
1、官网已经明确说了,ImageJ的版本不能低于ImageJ 1.40p,不符合的只能先升级更新一下再安装; 2、网站虽然没有明确说明,但是IHC Toolbox的正常使用需要java环境,也就是需要对电脑的系统环境变量进行相应的配置和编辑。这一步不能省略,否则插件无法正常使用。...
提前在 image J 官网下载插件 IHC Toolbox 并安装。 1.打开imageJ,open➡️选择需要分析的图片,导入; 2. Plugins➡️IHC Toolbox; 3.选择右上角矩形框➡️框选组织切片中典型的代表,面积不要太小也不要太大,不然软件会卡死(´△`)➡️点击 training 进行分析; ...
首先,你需要下载 ImageJ 软件,并安装好。然后,下载 IHC-Toolbox 插件,并将其放入 ImageJ 的安装目录下的 plugins 文件夹中。下载链接:### 开始分析 1. 在菜单栏中选择“文件”→“打开”,打开你的实验数据图片(这里使用的是网络图片,大家可以用自己的数据)。然后在“plugins”菜单下选择“IHC Toolbox”,打开...
首先,你需要下载 imageJ,然后下载 IHC-Toolbox 插件,并放入 imageJ 的安装目录下的 plugins 文件夹下; 送链接: https://imagej.nih.gov/ij/plugins/ihc-toolbox/index.html image 开始分析 ***1. ***在菜单栏里选择文件打开,打开实验数据图片(此处所使用图片来自互联网,大家可用自己的数据实战);然后在 pl...
IHC Toolbox 插件的下载链接:https://imagej./ij/plugins/ihc-toolbox/index.html。 安装方法: 打开待分析图片,使用矩形选框选中感兴趣的颜色(例如蓝色): Plugins -> IHC Toolbox,点击Traing: 此外,IHC Toolbox下Nuclei还可以进行细胞计数,例如下图计算DAB阳性的细胞数为392: ...
安装IHC Toolbox 这款插件是由英国诺丁汉大学的三位作者共同开发(Jie Shu, Guoping Qiu, Mohammad Ilyas)。插件下载网址在这里:https://imagej.nih.gov/ij/plugins/ihc-toolbox/index.html 点击IHC_Toolbox.jar便可以下载了,下载之后不要解压,直接放在ImageJ安装目录中“Plugins”这个文件夹当中即可。或者打开Imag...