Immunohistochemistry (IHC) Image Analysis Toolbox 界面中有5个按钮,例如训练,读取用户模型,颜色,细胞核和腺体以及保管箱Select_Model。这些函数描述如下。 训练(Training)按钮用于选择和过滤掉不需要的颜色像素(如以下训练过程所示)。 投递箱(Drop box)可以读取系统预定义的模型,例如 H-DAB 颜色检测模型。 读取用户...
点击IHC_Toolbox.jar便可以下载了,下载之后不要解压,直接放在ImageJ安装目录中“Plugins”这个文件夹当中即可。或者打开ImageJ,直接将下载好的IHC Toolbox拖拽到窗口亦可。 注意事项(避坑tips) 1、官网已经明确说了,ImageJ的版本不能低于ImageJ 1.40p,不符合的只能先升级更新一下再安装; 2、网站虽然没有明确说明,...
安装IHC Toolbox时，您可以将下载的IHC_Toolbox.jar拖放到“ImageJ”窗口，或通过“Plugins ->Install”命令下载并安装。工具箱界面包含5个按钮，分别对应于训练、读取用户模型、颜色、细胞核和腺体检测以及模型保存。每个功能的使用方法如下：训练过程：开始训练过程，训练基于视觉选择的颜色像素的统计颜色检...
用户创建的模型和参数可以保存并传输给不同的用户,以便在不同的实验室中重现检测结果。该工具中包含的功能是半自动颜色选择、自动统计颜色检测、自动细胞核分割和自动腺体检测(定位候选腺体的边界框并需要进一步分类,例如支持向量回归 (SVR)。 安装方法 将下载好的IHC_Toolbox.jar拖放到“ImageJ”窗口或使用Plugins->...
1、官网已经明确说了,ImageJ的版本不能低于ImageJ 1.40p,不符合的只能先升级更新一下再安装; 2、网站虽然没有明确说明,但是IHC Toolbox的正常使用需要java环境,也就是需要对电脑的系统环境变量进行相应的配置和编辑。这一步不能省略,否则插件无法正常使用。...
提前在 image J 官网下载插件 IHC Toolbox 并安装。 1.打开imageJ,open➡️选择需要分析的图片,导入; 2. Plugins➡️IHC Toolbox; 3.选择右上角矩形框➡️框选组织切片中典型的代表,面积不要太小也不要太大,不然软件会卡死(´△`)➡️点击 training 进行分析; ...
首先,你需要下载 imageJ,然后下载 IHC-Toolbox 插件,并放入 imageJ 的安装目录下的 plugins 文件夹下; 送链接: https://imagej.nih.gov/ij/plugins/ihc-toolbox/index.html image 开始分析 ***1. ***在菜单栏里选择文件打开,打开实验数据图片(此处所使用图片来自互联网,大家可用自己的数据实战);然后在 pl...
安装方法: 打开待分析图片,使用矩形选框选中感兴趣的颜色(例如蓝色): Plugins -> IHC Toolbox,点击Traing: 此外,IHC Toolbox下Nuclei还可以进行细胞计数,例如下图计算DAB阳性的细胞数为392: IHC Toolbox还可以进行腺体检测(Gland Detection): 2 ImageJ其他高效图片分析方法 ...
首先必须安装XL_Toolbox_6.60工具,安装后在Excel表格中就可以看见该插件。 选择图片后点击Export,选择最后一项Export forpublication 弹出以下窗口,选择导出格式,导出分辨率,图片的长和宽以及图片模式即可。 回顾 类似的ImageJ动态图像分析还有运动轨迹追踪,感兴趣的小伙伴可以在往...