提前在 image J 官网下载插件 IHC Toolbox 并安装。 1.打开imageJ,open➡️选择需要分析的图片,导入; 2. Plugins➡️IHC Toolbox; 3.选择右上角矩形框➡️框选组织切片中典型的代表,面积不要太小也不要太大,不然软件会卡死(´△`)➡️点击 training 进行分析; 4.忘记截图:完成上一步之后,...
将下载好的IHC_Toolbox.jar拖放到“ImageJ”窗口或使用Plugins->Install命令下载并安装。 ImageJ 窗口 使用说明 对于颜色检测,半自动颜色选择和自动统计颜色检测模型的功能组合在一起。颜色选择用于在消除背景色像素(设置为 255)时选择和保留正色像素。然后,根据这些保留的正彩色像素的直方图创建统计颜色模型。 自动细...
或者打开ImageJ,直接将下载好的IHC Toolbox拖拽到窗口亦可。 注意事项(避坑tips) 1、官网已经明确说了,ImageJ的版本不能低于ImageJ 1.40p,不符合的只能先升级更新一下再安装; 2、网站虽然没有明确说明,但是IHC Toolbox的正常使用需要java环境,也就是需要对电脑的系统环境变量进行相应的配置和编辑。这一步不能省...
安装IHC Toolbox时，您可以将下载的IHC_Toolbox.jar拖放到“ImageJ”窗口，或通过“Plugins ->Install”命令下载并安装。工具箱界面包含5个按钮，分别对应于训练、读取用户模型、颜色、细胞核和腺体检测以及模型保存。每个功能的使用方法如下：训练过程：开始训练过程，训练基于视觉选择的颜色像素的统计颜色检...
打开需要训练的图片,使用ImageJ中的矩形工具选择阳性细胞的细胞核,即“SelectROI”,点击IHCToolbox操作界面中的“Training”,将会弹出一个“ColorChooser”的对话框。对话框中的横轴便是用于调整阈值的数轴,当确定背景淡去的最佳数值时,点击“Collection”。此时...
高效分析步骤 1. 打开图片 2. 使用“Color Deconvolution”分离颜色 3. 测量胶原面积与组织总面积 计算胶原容积分数为：胶原面积 / 组织总面积 * 100%，精确至百分比。扩展：IHC Toolbox IHC Toolbox插件提供更多功能，包括细胞计数、腺体检测等。下载插件，使用矩形选框选取颜色，进行分析操作。其他高效...
https://imagej.nih.gov/ij/plugins/ihc-toolbox/index.html image 开始分析 ***1. ***在菜单栏里选择文件打开,打开实验数据图片(此处所使用图片来自互联网,大家可用自己的数据实战);然后在 plugins 菜单下 → 选择 IHC Toolbox,打开如下: image
方法一：使用批处理功能 一、处理流程 1、打开宏命令录制窗口：Plugins-Macros-Record 2、打开一张图片进行你要进行的操作 3、复制Recorder窗口里录制的宏命令 4、打开批处理Process-Batch-Macro...二、批处理的局限性：1、在处理过程中有部分插件的操作宏录制功能无法录制。如IHC Toolbox插件里面Select Model里面...
将下载好的IHC_Toolbox.jar拖放到“ImageJ”窗口或使用Plugins->Install命令下载并安装。 使用说明 对于颜色检测,半自动颜色选择和自动统计颜色检测模型的功能组合在一起。颜色选择用于在消除背景色像素(设置为 255)时选择和保留正色像素。然后,根据这些保留的正彩色像素的直方图创建统计颜色模型。
IHC Toolbox还可以进行腺体检测(Gland Detection): 2 ImageJ其他高效图片分析方法 Colour Deconvolution除了可以用来拆分Masson染色不同颜色外,还可以用于HE染色、Giemsa染色、免疫组化DAB染色等多种场景。 1. HE染色 得到苏木素染色蓝紫色细胞核后后续可方便进行细胞计数,例如使用Process–>Find Maxiam…计数。