提前在 image J 官网下载插件 IHC Toolbox 并安装。 1.打开imageJ,open➡️选择需要分析的图片,导入; 2. Plugins➡️IHC Toolbox; 3.选择右上角矩形框➡️框选组织切片中典型的代表,面积不要太小也不要太大,不然软件会卡死(´△`)➡️点击 training 进行分析; 4.忘记截图:完成上一步之后,...
首先,你需要下载 ImageJ 软件,并安装好。然后,下载 IHC-Toolbox 插件,并将其放入 ImageJ 的安装目录下的 plugins 文件夹中。下载链接:### 开始分析 1. 在菜单栏中选择“文件”→“打开”,打开你的实验数据图片(这里使用的是网络图片,大家可以用自己的数据)。然后在“plugins”菜单下选择“IHC Toolbox”,打开...
将下载好的IHC_Toolbox.jar拖放到“ImageJ”窗口或使用Plugins->Install命令下载并安装。 ImageJ 窗口 使用说明 对于颜色检测,半自动颜色选择和自动统计颜色检测模型的功能组合在一起。颜色选择用于在消除背景色像素(设置为 255)时选择和保留正色像素。然后,根据这些保留的正彩色像素的直方图创建统计颜色模型。 自动细...
或者打开ImageJ,直接将下载好的IHC Toolbox拖拽到窗口亦可。 注意事项(避坑tips) 1、官网已经明确说了,ImageJ的版本不能低于ImageJ 1.40p,不符合的只能先升级更新一下再安装; 2、网站虽然没有明确说明,但是IHC Toolbox的正常使用需要java环境,也就是需要对电脑的系统环境变量进行相应的配置和编辑。这一步不能省...
安装IHC Toolbox时,您可以将下载的IHC_Toolbox.jar拖放到“ImageJ”窗口,或通过“Plugins ->Install”命令下载并安装。工具箱界面包含5个按钮,分别对应于训练、读取用户模型、颜色、细胞核和腺体检测以及模型保存。每个功能的使用方法如下:训练过程:开始训练过程,训练基于视觉选择的颜色像素的统计颜色...
打开需要训练的图片,使用ImageJ中的矩形工具选择阳性细胞的细胞核,即“SelectROI”,点击IHCToolbox操作界面中的“Training”,将会弹出一个“ColorChooser”的对话框。对话框中的横轴便是用于调整阈值的数轴,当确定背景淡去的最佳数值时,点击“Collection”。此时...
高效分析步骤 1. 打开图片 2. 使用“Color Deconvolution”分离颜色 3. 测量胶原面积与组织总面积 计算胶原容积分数为:胶原面积 / 组织总面积 * 100%,精确至百分比。扩展:IHC Toolbox IHC Toolbox插件提供更多功能,包括细胞计数、腺体检测等。下载插件,使用矩形选框选取颜色,进行分析操作。其他高效...
IHC Toolbox 插件的下载链接:https://imagej./ij/plugins/ihc-toolbox/index.html。 安装方法: 打开待分析图片,使用矩形选框选中感兴趣的颜色(例如蓝色): Plugins -> IHC Toolbox,点击Traing: 此外,IHC Toolbox下Nuclei还可以进行细胞计数,例如下图计算DAB阳性的细胞数为392: ...
https://imagej.nih.gov/ij/plugins/ihc-toolbox/index.html image 开始分析 ***1. ***在菜单栏里选择文件打开,打开实验数据图片(此处所使用图片来自互联网,大家可用自己的数据实战);然后在 plugins 菜单下 → 选择 IHC Toolbox,打开如下: image
方法一:使用批处理功能 一、处理流程 1、打开宏命令录制窗口:Plugins-Macros-Record 2、打开一张图片进行你要进行的操作 3、复制Recorder窗口里录制的宏命令 4、打开批处理Process-Batch-Macro...二、批处理的局限性:1、在处理过程中有部分插件的操作宏录制功能无法录制。如IHC Toolbox插件里面Select Model里面...