关于index,也叫barcodes,因为一个lane可以同时测多个样品,为了避免混淆样品的read products,每种样品的DNA由一种index修饰,这样测序得到的reads都是具有index标记的,在测序结果中,依据之前标签与样品的对应关系,就可以获得对应样品的数据。而这里的index1和index2是为了区分paired-end测序得到的双端reads。 二、Cluster ...
接下来,进入另一个重头戏! 双端测序(Paired-end sequencing),这就是 Illumina 测序的另一个核心技术啦! 与单端测序不同,双端测序是从 DNA 或 RNA 样本的两端进行测序,从而获得更多的信息和更高的测序覆盖度。 简单来讲就是,一根链除了从正向读一遍,还要从负向再读一遍,这样是不是就可以把测序的有效长度增加...
接下来,进入另一个重头戏! 双端测序(Paired-end sequencing),这就是 Illumina 测序的另一个核心技术啦! 与单端测序不同,双端测序是从 DNA 或 RNA 样本的两端进行测序,从而获得更多的信息和更高的测序覆盖度。 简单来讲就是,一根链除了从正向读一遍,还要从负向再读一遍,这样是不是就可以把测序的有效长度增加...
下图是接头的一般结构,呈"Y"字型.index1和index2也是不同的,与P5相连的是index2,与P7相连的是index1.这里的index1和index2是为了区分paired-end测序得到的双端reads. 请注意测序引物和PCR扩增结合位点是不一样的 还有一点就是Rd2sq到底是怎么用的呢?当我们将rd2的引物结合后,可以发现接下来就可以合成...
(2)关于index,也叫barcodes,因为一个lane可以同时测多个样品,为了避免混淆样品的read products,每种样品的DNA由一种index修饰,这样测序得到的reads都是具有index标记的,在测序结果中,依据之前标签与样品的对应关系,就可以获得对应样品的数据。而这里的index1和index2是为了区分p...
Paired-end测序已经是现在的主流,它提高了测序长度的同时,又可以为结构变异分析提供新方法。要完成双末端测序,首先要将模板链3’去保护,模板折叠,index片段引入 在聚合酶参与下形成双链桥 然后变性,恢复为单链。注意,这次是将正向链切除并洗去,只留下反向链 ...
Illumina paired-endTaxonomy annotationRead joiningBackground: Illumina sequencing of a marker gene is popular in metagenomic studies. However, Illumina paired-end (PE) reads sometimes cannot be merged into single reads for subsequent analysis. When mergeable PE reads are limited, one can simply use...
关于index,也叫barcodes,因为一个lane可以同时测多个样品,为了避免混淆样品的read products,每种样品的DNA由一种index修饰,这样测序得到的reads都是具有index标记的,在测序结果中,依据之前标签与样品的对应关系,就可以获得对应样品的数据。而这里的index1和index2是为了区分paired-end测序得到的双端reads。
Paired-end测序已经是现在的主流,它提高了测序长度的同时,又可以为结构变异分析提供新方法。要完成双末端测序,首先要将模板链3’去保护,模板折叠,index片段引入 在聚合酶参与下形成双链桥 然后变性,恢复为单链。注意,这次是将正向链切除并洗去,只留下反向链 ...
Paired-end测序已经是现在的主流,它提高了测序长度的同时,又可以为结构变异分析提供新方法。要完成双末端测序,首先要将模板链3’去保护,模板折叠,index片段引入 在聚合酶参与下形成双链桥 然后变性,恢复为单链。注意,这次是将正向链切除并洗去,只留下反向链 ...