Results.html : de novo motif finding的格式化输出. Results.html :homer.ucsd.edu/homer/mo 寻找RNA序列的motif 寻找DNA序列的motif区别在于:使用 findMotifs.pl和 findMotifsGenome.pl时,要加上 “-rna”参数,从而只寻找RNA+链的motif,并且匹配/显示U而不是T。 !HOMER尚未包含“RNA motif”列表,...
和寻找DNA序列的motif区别在于:使用 findMotifs.pl和 findMotifsGenome.pl时,要加上 “-rna”参数,从而只寻找RNA+链的motif,并且匹配/显示U而不是T。 注意!HOMER尚未包含“RNA motif”列表,所以不支持“已知motif”的分析。如果使用FASTA文件格式,请在输入文件中使用T(DNA编码)。 代码示例1: # 获取目标序列在人...