找序列属于较花时间步骤,若研究的基因所属家族有人发过基因家族的纹章,则可以根据文献下载相关序列,若没有人研究,则需要对选取物种的基因组/CDS/PEP文件做blast/hmmsearch搜索以及后续繁琐的筛选。 这里我们选取的HD-ZIP III属于转录因子,则可以根据植物转录因子数据库(http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/)下载目标...
该家族通常包含一个HD结构域和一个ZIP结构域,HD结构域可以结合DNA,促进其转录激活,ZIP结构域则具有DNA绑定能力,使得该基因家族在植物的器官分化及发育过程中扮演重要角色。 HD-ZIP基因家族可以细分为四个亚家族:HD-ZIPI、HD-ZIPII、HD-ZIPIII和HD-ZIPIV。不同亚家族的成员在结构和功能上存在差异,但都参与植物...
鉴定出大麻HD-Zip家族分为4个亚家族:HD-ZipI家族14个,HD-Zip II家族7个,HD-Zip III家族3个,HD-Zip IV家族9个。大麻、水稻和拟南芥的协方差分析显示,大麻HD-ZIP家族与拟南芥和水稻的基因有20对同源基因,其中12对共有(图3)。不同物种的同源基因在进化过程中保持相同或相似的功能,基因的组织表达模式通常与基...
在基因表达方面,HD-ZIP基因家族分为四个亚家族:HD-ZIPI、HD-ZIPII、HD-ZIPIII和HD-ZIPIV。不同亚家族的成员具有不同的功能和表达模式。HD-ZIPI成员发挥着花器官和根的发育作用,主要表达在植物的生殖器官和根,而HD-ZIPII成员则与植物的过渡生长、叶枯萎和响应干旱等逆境有关。HD-ZIPIII成员主要参与叶片皮层发...
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在裸子植物白云杉 homeodomain-leucinezipperprotein,HD-Zip,该Piceaglauca和火炬 松Pinustaeda中分别克隆到 类蛋白属于同源异型域homeodomain,HD转录因4个和5个HD-Zip III基因C?téetal.,2010。双子叶 子超家族SchenaandDavis,1992;Elhitiand草本植物拟南芥 ArabidopsisthalianaHD-ZipIII家 Stasolla,2009。根据结构域...
木本植物毛果杨(Populus 应; HD-Zip IV主要调控植物表皮细胞的分化; 而 trichocarpa)HD-Zip III基因家族成员有8个, 为 HD-Zip III对植物多种细胞分化过程都起到重要调控 PtHB1–8 (Ko et al., 2006)。根据HD-Zip III的序列同 作用, 如胚胎形态发生、分生组织形成、侧生器官发 源性可以将其分为3组: ...
通过调控基因的转录,HD-Zip能够影响植物的生长速率、细胞分化、胁迫应答等生物学过程。 三、HD-Zip的研究进展 1. HD-Zip家族的分类 根据HD-Zip家族的同源异型区域结构的差异,可以将其分为I、II、III类家族。不同类别的HD-Zip家族在植物的生长和发育过程中有着不同的调节作用,研究人员可以根据这些差异来进行更...
目前对HD-ZIP基因家族的系统性研究主要集中在模式植物拟南芥和水稻中，而对其他物种特别是木本植物研究较少。杨树作为林业研究的模式植物, 具有优良的实验特性，容易进行种间杂交和无性繁殖；生长迅速，并已建立完善的遗传转化系统；基因组相对较小，约450～550 Mbp；易于进行遗传研究；适应性强，生长速度快，丰产性强...
MIR166基因家族在陆生植物中的进化模式分析(英文) HD-ZIP III转录因子MicroRNA(miRNA)是一类广泛存在于真核生物中的具有转录后水平调控功能的内源非编码小分子RNA。在植物中,miRNA通过对靶基因的剪切或沉默来实现对... - 《植物分类与资源学报》 被引量: 0发表: 2014年 早竹AP1/SQUA-,REV-,TB1-like基因的...