［结果］共鉴定到谷子ZF ⁃HD 家族基因16个，分布在8条染色体上；进化分析发现谷子ZF ⁃HD 家族基因可以分为5个亚类；motif 预测共鉴定到4个保守motif 基序；顺式作用元件分析发现与干旱响应相关的ZF ⁃HD 基因共9个；谷子ZF ⁃HD 家族基因与拟南芥中2个基因、水稻中13个基因存在共线性；5个ZF ⁃HD ...
本研究发现干旱胁迫24 h内,多数CnZF-HD家族基因的表达相比对照组先上调后下调,不同基因的表达量达到峰值的时间具有差异,其中CnZF-HD1的表达水平持续上调,在胁迫24 h达到峰值,表达量是对照的5.14倍,差异显著且明显高于其他家族基因的最...
大豆ZF-HD蛋白家族的全基因组序列特征分析
基于基因组测序结果, 利用生物信息学方法, 我们对甘蓝型油菜ZF-HD基因家族进行鉴定, 对其蛋白结构、基本理化特征、顺式作用元件和基因共线性等进行分析, 以期为深入揭示ZF-HD基因家族的生物学功能奠定基础, 并为揭示多基因家族在异源多倍体中的进化式样提供理论依据。 1 材料与方法 1.1 数据来源 甘蓝型油菜(Brassica ...
ZF-HD基因数量之和.同一亚群的motif数量和类型高度相似.共线性分析结果显示, 全基因组三倍体化使ZF-HD基因在二 倍体祖先得到扩张, 而异源多倍体化又进一步使甘蓝型油菜ZF-HD基因家族扩张.Ka/Ks值说明大多数ZF-HD基因在进化过 程中受到了纯化选择.所有BnZF-HD基因都具有光响应元件, 2/3的基因具有MeJA,ABA和...
[目的]解析转录因子ZF-HD在桉树生长发育中的作用,进而深入了解其在桉树中如何发挥功能.[方法]在本研究中利用生物信息学鉴定巨桉ZF-HD基因家族成员,并对其染色体定位,理化性质,基因结构,蛋白保守结构域和表达模式进行分析.[结果]桉树中共发现10个基因家族成员,编码78~343个氨基酸,几乎所有成员都属于碱性蛋白质,主要定位...
茶树ZF-HD家族蛋白可分为5个亚族(ZHDⅠ,ZHDⅡ,ZHDⅢ,ZHDⅣ和MIF),较拟南芥少了ZHDⅤ亚族.除CsZHD2,CsZHD12和CsZHD17基因在8个组织中不表达或表达量极低外,其他14个CsZHDs基因在8个组织中呈差异性表达;除CsZHD2,CsZHD12和CsZHD17基因外,其他15个CsZHDs基因在顶芽或花中表达量较高.在干旱胁迫...
题目研究发现基因家族存在一种“自私基因”,该基因可通过杀死不含该基因的配子来扭曲分离比例。若A基因是一种“自私基因”,在产生配子时,能杀死体内一半不含该基因的雄性配子。某基因型为Aa的植株自交获得的F1中红花(AA):粉红花(Aa):白花(aa)=2:3:1.则F1中个体随机受粉产生的后代的表现型及...
而PHD是14种已知锌指结构域中的1种,存在于400多种真核生物蛋白中,在进化过程中高度保守[3-4],因此命名为ZF-HD(Zinc finger homeodomain)蛋白。该类蛋白通过调节染色质状态来调控基因转录、细胞周期、细胞凋亡等生命活动,双子叶和单子叶植物中该类蛋白的突变分析表明叶片发育涉及分生组织特异的Knotted-like同源异形...