HD-ZIPI亚家族是HD-ZIP基因家族中最为广泛研究的亚家族。它主要在植物的胚胎发育和根、茎、叶、花等器官的形成中发挥重要作用。该亚家族的成员可以与其他转录因子相互作用,调控多个基因网络,进而影响植物的细胞分化和器官发育。例如,在胚胎发育过程中,HD-ZIPI家族的成员可以促进胚乳和子叶的发育。在形成根、茎、叶...
HD-ZIP 基因家族的成员通常包含一个能够与 DNA 结合的 homeodomain 和一个富含亮氨酸的 Leucine-zipper domain,这两部分结构常常连在一起,形成一个扁平的结构体,属于具有螺旋刚性的 DNA 结合蛋白。 HD-ZIP基因家族在植物的生长发育和响应逆境中起着重要的作用。HD-ZIP基因家族的成员参与了根、茎、叶、花、果实等...
棉花中关于 HD-Zip 家族基因在非生物胁迫中 的研究鲜有报道.本研究从全基因组范围系统鉴定 陆地棉中 HDZ 基因家族成员, 对 GhHDZ 家族进 行系统的生物信息学分析,并基于已建立的陆地棉 转录组数据分析该家族响应冷,热,盐,干旱胁迫 的表达特征,通过 RT-qPCR 对部分 GhHDZ 基因在 4 种非生物胁迫处理下的表达...
HDZIP基因家族在许多植物中都存在,并参与了植物的发育和逆境响应过程。因此,研究杨树的HDZIP基因家族对于了解杨树的分子调控机制和提高杨树的逆境耐受性具有重要意义。 为了研究杨树的HDZIP基因家族,研究人员首先进行了杨树全基因组的测序工作。通过这一工作,研究人员确定了杨树的基因组大小和结构,并获得了完整的杨树基因...
具体的,对于构建某一基因家族的进化树(以HD-ZIP3家族)来说分析流程如下: 基因家族分析流程 二、软件的准备 具体软件包括有: 比对软件:blast、hmmer 多序列比对:mafft、pal2nal.pl 保守信息位点筛选:Gblocks 系统进化树(ML树)的构建:iqtree 万能fastq/fasta小工具:seqkit ...
陆地棉HD-Zip家族全基因组鉴定及响应非生物胁迫的表达分析 吴翠翠, 肖水平 Genome-wide Identification of HD-Zip Gene Family in Gossypium hirsutum L. and Expression Analysis in Response to Abiotic Stress WU Cui-cui, XIAO Shui-ping 生物技术通报 . 2024, (2): 130 -145 . DOI: 10.13560/j....
1.梨CBL基因家族全基因组序列的鉴定及非生物胁迫下的表达分析2.薏苡bZIP基因家族全基因组鉴定与非生物胁迫表达分析3.青稞HD-Zip基因家族鉴定及其在非生物胁迫下的表达特性4.花生NAS家族全基因组鉴定及其基因表达对缺铁和镉胁迫的响应5.穿心莲TCP基因家族全基因组鉴定及非生物胁迫下的表达分析 因版权原因,仅展示原文概...
研究结果可为进一步解析黄瓜 HD-ZIP 家族基因的生物学功能和作用 机理提供了一定的参考价值。关于这项研究主要结果如下: 1.从黄瓜基因组数据库中鉴定了40 个编码 HD-Zip 蛋白的 CsHDZ 基因,并将这些 基因依据染色体上的位置,命名为 CsHDZ1-CsHDZ40。CsHDZ 基因大部分位于细胞 核,而 CsHDZ05、CsHDZ11、CsH...
HD-ZIP家族基因，对于HD-ZIP基因的结构、作用机制、克隆、分子进化及功能表达研究具有重要的指导意义。关键词：HD-ZIP进化树；结构分析；染色体定位；基序分析 1 前言 转录因子，是指那些能够结合在某基因上游的特异核苷酸序列上的蛋白质，活化后从细胞质转位至细胞核，通过识别和结合基因启动子区的顺式作用元件,启动...
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