找序列属于较花时间步骤,若研究的基因所属家族有人发过基因家族的纹章,则可以根据文献下载相关序列,若没有人研究,则需要对选取物种的基因组/CDS/PEP文件做blast/hmmsearch搜索以及后续繁琐的筛选。 这里我们选取的HD-ZIP III属于转录因子,则可以根据植物转录因子数据库(http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/)下载目标...
HD-ZIPI亚家族是HD-ZIP基因家族中最为广泛研究的亚家族。它主要在植物的胚胎发育和根、茎、叶、花等器官的形成中发挥重要作用。该亚家族的成员可以与其他转录因子相互作用,调控多个基因网络,进而影响植物的细胞分化和器官发育。例如,在胚胎发育过程中,HD-ZIPI家族的成员可以促进胚乳和子叶的发育。在形成根、茎、叶...
鉴定出大麻HD-Zip家族分为4个亚家族:HD-ZipI家族14个,HD-Zip II家族7个,HD-Zip III家族3个,HD-Zip IV家族9个。大麻、水稻和拟南芥的协方差分析显示,大麻HD-ZIP家族与拟南芥和水稻的基因有20对同源基因,其中12对共有(图3)。不同物种的同源基因在进化过程中保持相同或相似的功能,基因的组织表达模式通常与基...
HD-ZIP 基因家族的成员通常包含一个能够与 DNA 结合的 homeodomain 和一个富含亮氨酸的 Leucine-zipper domain,这两部分结构常常连在一起,形成一个扁平的结构体,属于具有螺旋刚性的 DNA 结合蛋白。 HD-ZIP基因家族在植物的生长发育和响应逆境中起着重要的作用。HD-ZIP基因家族的成员参与了根、茎、叶、花、果实等...
双子叶 子超家族SchenaandDavis,1992;Elhitiand草本植物拟南芥 ArabidopsisthalianaHD-ZipIII家 Stasolla,2009。根据结构域保守性、基因结构以及族共有5个成 员,分别是REVOLUTA/IFL1REV、 生理学功能,HD-Zip家族又可以分为HD-ZipI、 PHAVOLUTA/AtHB9PHV、PHABULOSA/AtHB14 HD-ZipII、HD-ZipIII和HD-ZipIV四个...
木本植物毛果杨(Populus 应; HD-Zip IV主要调控植物表皮细胞的分化; 而 trichocarpa)HD-Zip III基因家族成员有8个, 为 HD-Zip III对植物多种细胞分化过程都起到重要调控 PtHB1–8 (Ko et al., 2006)。根据HD-Zip III的序列同 作用, 如胚胎形态发生、分生组织形成、侧生器官发 源性可以将其分为3组: ...
最终,研究人员确定了杨树中的HDZIP基因家族成员。 通过对杨树HDZIP基因家族成员的分析,研究人员发现这些基因在杨树的不同组织和发育阶段中具有不同的表达模式。一些HDZIP基因在杨树的叶片和根系中高度表达,而另一些基因在花序和种子中高度表达。这表明杨树的HDZIP基因在不同组织和发育阶段中具有不同的功能。 此外,...
MIR166基因家族在陆生植物中的进化模式分析(英文) HD-ZIP III转录因子MicroRNA(miRNA)是一类广泛存在于真核生物中的具有转录后水平调控功能的内源非编码小分子RNA。在植物中,miRNA通过对靶基因的剪切或沉默来实现对... - 《植物分类与资源学报》 被引量: 0发表: 2014年 早竹AP1/SQUA-,REV-,TB1-like基因的...
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HD-ZIP III(HDZ3)转录因子在植物生长、发育和胁迫响应中发挥着重要的调控作用。然而,HDZ3转录因子是否以及如何参与茶树的干旱响应和抗性尚不明确。近日,我校数字经济学院(安溪茶学院)郭玉琼教授团队在国际权威期刊International Journal...