HD-ZIP 基因家族的成员通常包含一个能够与 DNA 结合的 homeodomain 和一个富含亮氨酸的 Leucine-zipper domain,这两部分结构常常连在一起,形成一个扁平的结构体,属于具有螺旋刚性的 DNA 结合蛋白。 HD-ZIP基因家族在植物的生长发育和响应逆境中起着重要的作用。HD-ZIP基因家族的成员参与了根、茎、叶、花、果实等...
HD-ZIPI亚家族是HD-ZIP基因家族中最为广泛研究的亚家族。它主要在植物的胚胎发育和根、茎、叶、花等器官的形成中发挥重要作用。该亚家族的成员可以与其他转录因子相互作用,调控多个基因网络,进而影响植物的细胞分化和器官发育。例如,在胚胎发育过程中,HD-ZIPI家族的成员可以促进胚乳和子叶的发育。在形成根、茎、叶...
HDZIP基因家族在许多植物中都存在,并参与了植物的发育和逆境响应过程。因此,研究杨树的HDZIP基因家族对于了解杨树的分子调控机制和提高杨树的逆境耐受性具有重要意义。 为了研究杨树的HDZIP基因家族,研究人员首先进行了杨树全基因组的测序工作。通过这一工作,研究人员确定了杨树的基因组大小和结构,并获得了完整的杨树基因...
组织学染色显示,所有三个HD-Zip IV基因在花柱的上部区域特异性表达,而Wo的表达高于HD7和HD7L(图3A)。支持它们在雄蕊中的功能,三个HD-Zip IV基因在花药之间的连接处高度表达,其中HD7和HD7L的表达高于Wo(图3B和图S3F)。空间和时间上的表达模式表明,Wo可能主要在花柱中发挥作用,而HD7和HD7L在花药锥形成中起...
2. 江西省经济作物研究所,南昌 330000 ;3. 棉花生物育种与综合利用全国重点实验室,安阳 455000) 摘要 :【目的】HD-Zip(Homeodomain and Leucine zipper)家族是植物特有的转录因子家族之一,在植物的生长发育,逆 境响应中发挥重要作用.从陆地棉全基因组范围内鉴定 GhHDZ 基因家族成员,分析相关基因表达特点,为后续深入...
转录因子在植物生长发育中起重要作用,通常是通过介导靶基因起到调控作用,其中HD-Zip是一类保守的转录因子家族,在响应非生物胁迫应答中起主要调控作用(表1)。目前已有研究表明,转录因子受胁迫响应诱导表达,如OsMYB3R-2、CBF1、OsSDIR1、ABF2和SlHZ24[21-...
该家族的特征在于其DNA结合结构域中含有一个同源异型域(Homeodom本人n)和一个亮氨酸拉链(Leucine Zipper),这两者相互作用形成了植物中染色体的三维结构,影响了基因的启动和转录。 二、HD-Zip的结构与功能 1. HD-Zip的结构 HD-Zip在细胞内存在于细胞核中,由同源异型区域和亮氨酸拉链区域组成。同源异型区域是HD-...
利用相关分析位点对大麻HD-Zip基因家族成员进行分析(表1),研究结果表明其相对分子量为23264.32Da~93147.87Da,相关氨基酸计数为136~849aa,等电点为4.54~9.04。结果表明,所有大麻HD-Zip蛋白都是亲水性的,但亲水性程度不同。大麻HD-Zip基因家族参与者的预期亚细胞定位证实,除了CsHD20蛋白定位于细胞质外,所有蛋白都定位...
HDZip顺式作用元件是植物特有的转录因子,属于HD-Zip家族。它们主要通过顺式作用调控植物的生长发育过程,如细胞分化、形态建成等。HD-Zip蛋白通常含有1-2个Homeobox结构域和一个Leucine zipper结构域,其中Homeobox结构域负责DNA结合,Leucinezipper结构域则参与蛋白的二聚化,两者协同作用来实现基因表达的调控。在植物生长发...
具体的,对于构建某一基因家族的进化树(以HD-ZIP3家族)来说分析流程如下: 基因家族分析流程 二、软件的准备 具体软件包括有: 比对软件:blast、hmmer 多序列比对:mafft、pal2nal.pl 保守信息位点筛选:Gblocks 系统进化树(ML树)的构建:iqtree 万能fastq/fasta小工具:seqkit ...