为了研究杨树的HDZIP基因家族,研究人员首先进行了杨树全基因组的测序工作。通过这一工作,研究人员确定了杨树的基因组大小和结构,并获得了完整的杨树基因组序列。接着,研究人员对杨树基因组中的HDZIP基因进行了鉴定和注释。他们使用了多种生物信息学工具和数据库,对杨树基因组中的候选HDZIP基因进行了筛选和分析。最终,...
杨树HD-ZIP基因家族全基因组研究 作者:**指导教师:** (安徽农业大学林学与园林学院,安徽合肥230036) 摘要:同源异型-亮氨酸拉链(HD-ZIP)蛋白是植物所特有的一类转录因子,类属于同源异型 盒蛋白家族,它包含一个高度保守的同源异型结构域(HD),HD羧基末端紧连接着一个亮氨 ...
杨树HD-ZIP基因家族全基因组研究 作者：陈雪指导教师：项艳 (安徽农业大学林学与园林学院，安徽合肥230036)摘要：同源异型-亮氨酸拉链(HD-ZIP)蛋白是植物所特有的一类转录因子，类属于同源异型盒蛋白家族，它包含一个高度保守的同源异型结构域(HD)，HD羧基末端紧连接着一个亮氨酸拉链(LZ)结构域。HD-ZIP蛋白在植物...
目前对HD-ZIP基因家族的系统性研究主要集中在模式植物拟 南芥和水稻中,而对其他物种特别是木本植物研究较少。杨树作为林业研究的模式植物, 具 有优良的实验特性,容易进行种间杂交和无性繁殖;生长迅速,并已建立完善的遗传转化系 统;基因组相对较小,约450～550 Mbp;易于进行遗传研究;适应性强,生长速度快,丰 产性...
本文利用生物信息学方法,以杨树最新基因及蛋白序列为材料,通过对杨树全基因组进行BLASTP和HMM的分析比对,最终获得了54个HD-ZIP类型基因 (PtHB1-54).对获得的杨树HD-ZIP类型基因进行进化树的构建分析,结果显示其进化树簇状分枝明显,亲源关系较近的基因倾向分布在同一分枝中.根据分枝的关系将54个杨树HD-ZIP基因分为...