显性负效应通常发生在蛋白质调节通过多聚体介导的情况下(28)。在番茄中Wo蛋白的免疫沉淀质谱(IP-MS)分析中(25),我们发现Wo能够与几种类似的HD-Zip IV蛋白相互作用,包括HD7L和HD7(表S1)。使用免疫共沉淀(Co-IP)和双分子荧光互补(BiFC)分析,证明了woW106R突变体形式的蛋白质也可以与这些蛋白质相互作用(图2F...
HD-Zip Ⅰ 亚家族编码的蛋白质量约为35 kD[15],HD-Zip Ⅰ亚家族在拟南芥中有17个成员,分别为ATHB1/HAT5、ATHB3/HAT7、ATHB5~7、ATHB12、ATHB13、ATHB16、ATHB20~23、ATHB40、ATHB 51~54[16],水稻中的 HD-Zip Ⅰ亚家族有14 个成员,杨树中...
sp=Ath\&fam=HD-ZIP##下载拟南芥CDS序列wget http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/download/seq/Ath_cds.fas.gz 根据文献,HD-ZIP III家族包括以下蛋白结构域。其中,MEKHLA属于HD-ZIP3的识别结构域,根据数据库Pfam数据库下载此结构域的hmm模型文件 HDZIP3蛋白结构域信息 wget http://pfam.xfam.org/family/PF0...
在其整个生长发育过程中发挥着重要的作用.HD-ZIP 家族 蛋白是植物中特有的一大类转录因子, 包含 4 个亚家族(HD-ZIP I~IV), 其中 HD-ZIP I 亚家族成员主要参与干旱,渗 透压等极端环境和 ABA 及乙烯等激素处理的响应过程.本文采用隐马可夫模型(HMM)在玉米参考基因组中鉴定到 17 个 HD-ZIP I 亚家族成员...
HDZip顺式作用元件是植物特有的转录因子,属于HD-Zip家族。它们主要通过顺式作用调控植物的生长发育过程,如细胞分化、形态建成等。HD-Zip蛋白通常含有1-2个Homeobox结构域和一个Leucine zipper结构域,其中Homeobox结构域负责DNA结合,Leucinezipper结构域则参与蛋白的二聚化,两者协同作用来实现基因表达的调控。在植物生长发...
HD-Zip IV家族蛋白是转录调控因子,通常参与植物表皮细胞发育。在拟南芥中,表皮分化受两个HD-Zip IV基因调控,即拟南芥分生组织LAYER1 (AtML1)和原皮因子2 (PDF2)。在番茄中,AtML1和PDF2的同源物Woolly (Wo)控制叶片和茎表面毛状体的形成和分化,作为抵御食草动物的一部分。
建立一个无根的系统发育树来评估陆地棉 HDZ 之间 的遗传进化关系.结果(图 1)表明,GhHDZ 家族 蛋白可划分为 4 个亚组,分别命名为 HD-ZipI,HD- ZipII,HD-ZipIII,HD-ZipIV.陆地棉中,HD-ZipI 亚 组中含有 73 个 GhHDZ 基因,是含基因数量最多的 一组 ;HD-ZipII-IV 成员的数量分别为 36,59 和 37 ...
结果表明,所有大麻HD-Zip蛋白都是亲水性的,但亲水性程度不同。大麻HD-Zip基因家族参与者的预期亚细胞定位证实,除了CsHD20蛋白定位于细胞质外,所有蛋白都定位于细胞核中。这些结果可能为研究大麻中HD-Zip 基因的家族功能提供理论依据。 表1. CsHD基因家族的信息和特征。
HD-ZIP家族蛋白是植物中特有的一大类转录因子, 包含4个亚家族(HD-ZIP I~IV), 其中HD-ZIP I亚家族成员主要参与干旱、渗透压等极端环境和ABA及乙烯等激素处理的响应过程。本文采用隐马可夫模型(HMM)在玉米参考基因组中鉴定到17个HD-ZIP I亚家族成员, 这些基因不均匀分布于玉米6条染色体上, 与水稻的亲缘关系要...
采用EMBOSS Programs、MEGA、GSDS、MEME、MCScanX、OrthoMCL、Circos等软件预测辣椒HD-Zip基因家族成员蛋白理化性质,构建系统进化树,定位染色体,分析基因结构、基因复制类型及直系、旁系同源基因。基于GEO数据库,运用R软件、本地perl语言及Cytoscape分析辣椒HD-Zip组织表达差异并绘制共表达网络。【结果】本研究在‘遵辣1号...