如果错误仍然存在,检查method参数是否设置正确(如"complete"、"single"、"average"等)。此外,确保没有其他潜在的编程错误或数据问题。 查阅官方文档或相关社区: 如果问题仍未解决,建议查阅R语言的官方文档或相关社区(如Stack Overflow)以获取更多帮助。 通过遵循上述步骤,你应该能够解决在调用hclust函数时遇到的“外接...
method 要使用的聚集方法。这应该是 "ward.D"、 "ward.D2"、 "single"、 "complete"、 "average" (= UPGMA)、"mcquitty" (= WPGMA)、"median" (= WPGMC) 之一(的明确缩写) )或"centroid"(= UPGMC)。 members NULL 或长度大小为 d 的向量。请参阅“详细信息”部分。 x hclust 生成的类型的对象...
out.hclust=hclust(out.dist,method="complete") #根据距离聚类 注释:聚类也有多种方法: 1,类平均法:average 2,重心法:centroid 3,中间距离法:median 4,最长距离法:complete 默认 5,最短距离法:single 6,离差平方和法:ward 7,密度估计法:density 接下来把聚类的结果图画出来 plclust(out.hclust) #对结果画...
it generates the error Error in hclust(d, method = "average") : NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 11) This is true regardless of whether I change to fun="mean" or specify "median" or both Traceback: 2: hclust(d, method = "average") 1: plotClusterHeatmap(sce, hm2 = NUL...
- method:是聚类的方法,可以是以下几种之一: - "ward.D"或"ward.D2":Ward's方法,最小化簇内的平方误差和。 - "single":单链接法,选择距离最近的两个簇进行合并。 - "complete":全链接法,选择距离最远的两个簇进行合并。 - "average"或"UPGMA":平均链接法,选择平均距离最小的两个簇进行合并。 - "...
为什么会有如下报错,要怎么解决呢?:Error in hclust(dist(datExpr0), method = "average") : ...
4 fit.average <- hclust(d2,method = 'average') 5 plot(fit.average,hang=-1,cex=.8,main='Average Linkage Clustering') 1. 2. 3. 4. 5. 结论:只能提供食物营养成分的相似性和相异性 1.3获取聚类的个数 1 library('NbClust') 2 devAskNewPage(ask = T) ...
其中method包括6种方法,表示不同的距离测度:"euclidean", "maximum", "manhattan", "canberra", "binary" or "minkowski"。相应的意义自行查找。 二、再用hclust()进行聚类 hc.r = hclust(dist.r, method = “”) 其中method包括7种方法,表示聚类的方法:"ward", "single", "complete","average", "mcqu...
#设定聚类方法,使用hclust函数里,提供了包括single(最短距离法),complete(最长距离法),average(群平均法),ward(离差平均法,欧式距离),也可以使用kmeans函数算法 cl <- hclust(dist(hc[2]),method="complete") #分割聚类数为k类,此处设定为3类 memb <- cutree(cl, k=k) ...
EN在使用互联网的过程中,我们经常会遇到一些网页无法访问或已被删除的情况。然而,有时候我们仍然希望...