在处理使用hclust函数进行层次聚类时遇到的“外接函数调用时不能有na/nan/inf(arg10)”错误时,可以按照以下步骤进行排查和解决: 1. 检查hclust函数的输入数据d 首先,需要确保输入给hclust函数的距离矩阵d中不包含NA、NaN或Inf值。这些值会干扰聚类算法的正常执行。 2. 查找和替换或删除非法值 查找非法值 可以使用...
方法= hclust.method)：外部函数调用中的NA/NaN/Inf (arg 10) -但是没有NA/NaN/Inf值ENpython中的...
d,method=“complete”）方法的作用是什么？系统聚类，d是又dist构成的距离结构，method是系统聚类的方法...
直接取log绘制不报错,但做scale时报错: Errorinhclust(d,method=method):NA/NaN/Infinforeignfunctioncall(arg11) 原因是数据中有标准差sd为0的行,做归一化时报错。pheatmap中做归一化采用的是scale方法: 因此如果要做scale,需要将这样的行去掉: test<-data[apply(data, 1,function(x) sd(x)!=0),]pheatmap...
2、Error in hclust(dist(test)) : NA/NaN/Inf in foreign function call (arg
NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 11) Calls: pheatmap -> cluster_mat -> hclust Executi...
Hi Helena, I am having issues generating the cluster heat maps after performing flowSOM clustering. When I run plotClusterHeatmap(sce, hm2 = NULL, k = "meta20", m = NULL, scale = TRUE) it generates the error Error in hclust(d, method = "...
10在进行WGCNA时，为什么会有如下报错，要怎么解决呢?：Error in hclust(dist(datExpr0), method = "...
记录一个小bug: 使用pheatmap绘制热图时,使用scale参数总报错: image.png 只需要删除原始数据中标准差为0的行即可: top_de_exp<-top_de_exp[apply(top_de_exp,1,function(x){sd(x)!=0}),] 原因是scale对每行进行以下处理: image.png 其分母(每行的标准差)不能为0...
问pheatmap方法“row”在hclust(d，scale== method)中出现错误:外部函数调用中有NA/NaN/InfEN热图绘制 ...