在处理使用hclust函数进行层次聚类时遇到的“外接函数调用时不能有na/nan/inf(arg10)”错误时,可以按照以下步骤进行排查和解决: 1. 检查hclust函数的输入数据d 首先,需要确保输入给hclust函数的距离矩阵d中不包含NA、NaN或Inf值。这些值会干扰聚类算法的正常执行。 2. 查找和替换或删除非法值 查找非法值 可以使用...
d,method=“complete”）方法的作用是什么？系统聚类，d是又dist构成的距离结构，method是系统聚类的方法...
hclust(d, method = "complete", members = NULL) ## S3 method for class 'hclust' plot(x, labels = NULL, hang = 0.1, check = TRUE, axes = TRUE, frame.plot = FALSE, ann = TRUE, main = "Cluster Dendrogram", sub = NULL, xlab = NULL, ylab = "Height", ...) 参数 d 由dist...
方法= hclust.method)：外部函数调用中的NA/NaN/Inf (arg 10) -但是没有NA/NaN/Inf值ENpython中的...
这里,我们使用cor函数,并设置method="pearson"来计算相关系数矩阵。 6. 进行层次聚类 获得相关系数矩阵后,我们将构建距离矩阵,并使用hclust进行层次聚类。 # 计算距离矩阵distance_matrix<-as.dist(1-correlation_matrix)# 进行层次聚类hc<-hclust(distance_matrix,method="complete") ...
hclust(d, method = "complete") 其中, - d:是一个距离矩阵,表示数据集中每对观测值之间的距离。 - method:是聚类的方法,可以是以下几种之一: - "ward.D"或"ward.D2":Ward's方法,最小化簇内的平方误差和。 - "single":单链接法,选择距离最近的两个簇进行合并。 - "complete":全链接法,选择距离最...
Cluster method : complete Number of objects:5plot(myhc,hang=0.1) 2、热图聚类过程: 一、首先用dist()函数计算变量间距离 dist.r = dist(data, method=" ") 二、用heatmap()函数进行热点图聚类 对于heatmap中具体参数,这里不做过多介绍,可在帮助文档中找说明。除此heatmap函数之外,gplots包中的heatmap....
2、Error in hclust(dist(test)) : NA/NaN/Inf in foreign function call (arg
# 计算欧氏距离的相似性矩阵dist_matrix<-dist(data,method="euclidean")# 查看相似性矩阵dist_matrix 1. 2. 3. 4. 5. 步骤3:构建层次聚类树 通过相似性矩阵,我们可以使用hclust函数构建层次聚类树。hclust函数接受相似性矩阵作为输入,并根据指定的聚类方法进行聚类。
tree <- hclust(d = dist(x = iris[1:50, 1:4], method ="euclidean")) cl_members <- cutree(tree = tree, k = 3) plot(x = tree, labels = row.names(tree), cex = 0.5) rect.hclust(tree = tree, k = 3,which= 1:3, border = 1:3, cluster = cl_members) ...