这两个概念,一个是对基因频率进行的筛选(MAF) 一个是对基因型频率进行的筛选(哈温). 对于一个位点"AA AT TT",其中A的频率是基因频率,AA为基因型频率. MAF直接是对基因频率进行筛选, 而哈温平衡检验,则是根据基因型推断出理想的(AA,AT,TT)的分布,然后和实际观察的进行适合性检验,然后得到P值,根据P值进行...
二基因型频率将以p^2,2pq和q^2的比例存在于随机交配的以后的各代中。群体的基因型频率以这个比率存在时就称为哈迪-温伯格平衡(Hardy–Weinberg equilibrium)。哈迪-温伯格定律的一个重要的应用是对达到平衡的群体来说从他们基因频率可以确定其基因型频率。 总之在理想群体中,哈迪-温伯格定律可以预计基因频率和基因型...
画图 myTest <- HWExact(genotypes) names(myTest) <- rownames(genotypes) plot(-log10(myTest), type="b", ylab="-log10(p-value)", main="HWE p-values for SNPS") abline(h=-log10(0.05), col="red") image.png 输出结果 sum(myTest<0.05) names(myTest)[which(myTest<0.05)] P(HW...
Hardy–Weinbergequilibrium Hardy–Weinberg equilibrium,叫做哈迪-温伯格平衡。该定律 提出,对于一个足够大的群体,在群体中各个个体之间随机交配,在 没有突变,个体迁移,遗传漂变等因素发生的情况下,这个种群的基 因频率和基因型频率可以一代代稳定不变,保持平衡。 对于二倍体生物而言,等位基因 A 的频率用 p 表示,...
hardy-weinberg 平衡 (hardy-weinberg equilibrium, HWE), 也叫遗传平衡定律,哈代-温伯格定律,核心在于数学等式“x + y = 1 时, [x^2 + 2xy + y^2 = 1] ”。现在,在最简单条件下,当我们只考虑一个基因的两种等位基因 A 和 a 时,A 和 a 的百分比加起来必然是100%,也就是1 。我们用 p 来表示 ...
英文: Conclusion The population deviated from Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05). 中文: 结论群体均偏离了哈迪一温伯格平衡(P<0.05)。更详细... 英文: Application of chi-square test and exact test in Hardy-Weinberg equilibrium testing; 中文: 卡方检验和精确检验在HWE检验中的应用更详细... ...
群体遗传学 Hardy-Weinberg 平衡定律检验 作者: 路文盛 版本: V2.0实际频数 预计频数 基因频率CC196187.3615 0.728625CT5774.27695 0.211896TT167.361524 0.05948N 269C 449 0.834572T 89 0.165428n 538χ214.55387P 0.000136 结论: 当P>0.05时,说明群体基因遗传平衡,数据来自同一蒙德尔群体。
weinberghardy哈迪equilibrium伯格平衡 Hardy-Weinbergequilibrium ifp=frequencyofalleleA q=frequencyofallelea p+q=1,(p+q) 2 =1 p 2 +2pq+q 2 =1 ifonlylawofprobabilityaffectsthe frequencyw/whichgametescombine toformnewindividuals Bisexualpopulation Largepopulation Randommating Nomutation Migration~0 Natur...
哈迪-温伯格平衡定律(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)方便计算 群体遗传学HardyWeinberg平衡定律检验 作者:路文盛 版本:V2.0 实际频数预计频数基因频率 CC196 187.36150.728625 CT57 74.276950.211896 TT16 7.3615240.05948 N 269 CTn 结论:当P>0.05时，说明群体基因遗传平衡，数据来自同一蒙德尔群体。44989538 ...