GWAS catalog数据库于2008年由National Human Genome Research Institute (NHGRI)建立,旨在应对快速增长的全基因组关联分析(GWAS)数据。该数据库为我们检索已发表GWAS与显著相关提供了方便。 该数据库中主要包含了已发表或未发表GWAS的Summary statistics ,截止到2024年3月28日,GWAS catalog已经收录了6,799篇文献,包括58...
搜索染色体位置：如2q37.1，Cytogenetic region 搜索基因：如HBS1L 搜索区域：如6:16000000-25000000 说是数据库，其实就是一个table，从这里下载，不过100MB 表里面有这些数据：DATE ADDED TO CATALOG* +: Date a study is published in the catalog PUBMEDID* +: PubMed identification number FIRST...
GWAS Catalog是EBI(欧洲生物信息学研究所)旗下的一个数据库,专门收录了公开发表的GWAS分析结果。截止目前,GWAS Catalog已经收录了超过16万个SNP(单核苷酸多态性)位点和疾病之间的关联信息。这些信息来自全球各地的科研团队,经过严格的质量控制和统计分析,具有很高的参考价值。 通过GWAS Catalog的官网,用户可以方便地进行...
GWAS,全称Genome-wide association study,即全基因组关联分析,旨在找出与疾病相关的基因变异。以下是几个常用的GWAS数据库,快来看看吧! ✅ GWAS Catalog 📖 这个数据库由EMBL-EBI管理,收录了大量公开发表的GWAS分析结果。你可以找到关联的基因、基因变异、疾病或表型特征等信息。每个关联都提供了详细的文献引用和遗...
GWAS Catalog(全称:Genome-Wide Association Study Catalog)是一个存储基因组范围关联研究(GWAS)结果的数据库。收集、整理和提供了各种研究中发现的基因-表型关联数据。其是EMBL-EBI旗下的一个数据库,收录了比较全的公开发表的GWAS分析结果。 该数据库提供了以下信息:关联的基因和基因变异、关联疾病或表型特征、关联研...
GWAS Catalog是EBI旗下的一个数据库,收录了公开发表的GWAS分析结果,截止2019-11-21,收录了16万个SNP位点和疾病之间的关联信息,更多信息汇总如下 通过官网,可以方便的检索,查询和下载对应的信息,常用的有以下3个模块 1. Search 可以根据以下多种条件进行检索 ...
首先,我们来看一下GWAS Catalog数据库。这是一个存储基因组范围关联研究(GWAS)结果的数据库,由EMBL-EBI旗下提供。该数据库收录了比较全的公开发表的GWAS分析结果,提供了关联的基因和基因变异、关联疾病或表型特征、关联研究的文献引用和出版物等信息。用户可以通过搜索功能根据多种条件进行检索,例如关联的基因和基因变...
根据GWAS Catalog提供的实验因素本体(EFO),我们筛选掉了那些性状描述未映射到EFO中的疾病术语的GWAS数据。 同时,我们仅保留了根据国际疾病分类(ICD-10)、癌症代码和非癌症疾病代码与疾病相关的UKBB GWAS数据。 考虑到转录组广泛关联研究(TWAS)预测模型是基于欧洲血统的参考数据构建的,我们只保留了当前版本的PharmGWAS中...
GWAS catalog 数据库 1. 简要介绍GWAS Catalog(全称:Genome-Wide Association Study Catalog)是一个存储基因组范围关联研究(GWAS)结果的数据库。收集、整理和提供了各种研究中发现的基因-表型关联数据。(网页链接:https://www.ebi.ac.uk/gwas/)该数据库提供了以下信息:关联的基因和基因变异、关联疾病或表型特征、关...
GWAS-Catalog是该研究所一个科研小组整理的GWAS数据,目前来说是更新最快,数据较为全面的一个GWAS数据库。 GWAS-Catalog GWAS-Catalog,中文名为GWAS目录。 网址:ebi.ac.uk/gwas/home; 打开页面如上,我们可以直接搜索表型,rsID,染色体编号,基因名等;一般我们直接搜索表型就行,这里我们就以Examples中的breast ...