在许多情况下,无法打开GWAS数据库可能是由于网络问题。如果网络连接不稳定或者速度过慢,可能会导致数据库加载失败。用户可以通过检查网络连接,重新连接网络,或者尝试使用其他网络环境来解决这个问题。 II、浏览器问题 另一个可能导致GWAS数据库打不开的原因是浏览器问题。一些老旧的浏览器可能不支持访问某些数据库,或者浏...
首先,进入GWAS catalog的官网(https://www.ebi.ac.uk/gwas/),点击Summary statistics(如下图所示) 进入Summary statistics后点击Available studies(如下图所示) 最后,你将进入如下界面(链接:https://www.ebi.ac.uk/gwas/downloads/summary-statistics) 该界面主要由三部分组成 第一块是 “List of published studi...
Beta 表示由于基因型改变而造成的表型变化的程度
分析方法: 使用MANOVA对寿命、健康寿命、父母寿命三个不同的GWAS summary文件进行荟萃分析。随后对感兴趣的基因座按照性别和年龄进行分层分析,用GWAS catalog和PhenoScanner查找感兴趣基因的相关表型。使用SMR进行基因表达共定位分析,使用FUMA的Gene2Func进行基因富集分析,使用TwoSampleMR进行孟德尔随机化随机化; 结论: 通过...