ReaxFF=Reactive force field:ADF、MS、lammps支持,作者本人也有相应的程序但不公开。这是反应力场,引入键级概念,可以研究模拟过程中的设计拓扑结构改变的化学反应,挺流行。对于结构新鲜的体系可能差一些。用于爆炸、燃烧过程的反应貌似不错。支持所有主族和部分过渡金属元素。电荷由EEM获得。参数很多很复杂难找全。形式复...
ReaxFF=Reactive force field:ADF、MS、lammps支持,作者本人也有相应的程序但不公开。这是反应力场,引入键级概念,可以研究模拟过程中的设计拓扑结构改变的化学反应,挺流行。对于结构新鲜的体系可能差一些。用于爆炸、燃烧过程的反应貌似不错。支持所有主族和部分过渡金属元素。电荷由EEM获得。参数很多很复杂难找全。形式复...
精细化如CVFF，专为有机分子设计，精细到每一个原子的交互；CFF则覆盖更广泛的分子类型，适用于凝聚相模拟，如COMPASS的优化。反应力场的独特之处在于:</ REBO是固体领域的专家，无非键参数，但后来引入了C、H的LJ参数，使得ReaxFF在处理化学反应，如爆炸和燃烧过程时表现出色，支持多种元素，尽管计算速...
介绍分子力场中可以使用的原子电荷(RESP、RESP2、ADCH、EEM、QEq、CM5、AM1-BCC、ABCG2、MMFF94等)的特点和产生方法。最后介绍ReaxFF、Reactive INTERFACE (IFF-R)、REBO反应力场 分子动力学的基本原理与算法(100多页):全面介绍分子动力学涉及的相关知识和模拟技术,包括相空间、系综、时间平均与系综平均、统计...
蛋白质、聚合物和无机材料。反应力场如REBO和ReaxFF则特别针对化学反应的模拟，引入了键级概念，处理化学结构变化。对于不同需求，如快速模拟大分子或精确计算小分子结构，会选择适合的力场组合，如COMPASS和Dreiding等。总的来说，力场的选择取决于模拟的精确度、计算效率和所研究的具体系统特性。
Lammps有ReaxFF反应力场但GROMACS没有，具体的区别还需要你自己去跑案例，如果觉得太麻烦可以到北鲲云超算平台去试一下。这两个软件那上面都有，开源的直接用就行，也有模板可以套，比较快。
reaxFF仿真... 使用Materi...精华评论 pigrass 不知道楼主为什么会在蛋白质软件里用到clayff clayff推荐用MS软件的gulp模块,或者lammps 姬宫千歌音 2楼: Originally posted by pigrass at 2013-11-06 16:34:34 不知道楼主为什么会在蛋白质软件里用到clayff clayff推荐用MS软件的gulp模块,或者lammps 我看到很多...
reaxFF仿真... 请问这种二级结构... 电脑刚安装薛定谔... gmx curr...精华评论 jiaoyixiong 1、不知道语句怎么编写 ,你应该去仔细阅读手册啊。 2、据我所知,没有自带的“醇、乙醇、尿素的结构”,不过这些小分子你可以直接找到他们的PDB 文件和力场参数,具体的混合你可以试试packmol,一个很小但是很好用的...
所以依据你的课题项研究的问题，建议换用lammps的reaxff或者cp2k里的gfn1-xtb方法
大家好，请问Lammps与GROMACS的重要区别是什么？我记得一个区别是Lammps有ReaxFF反应力场但GROMACS没有。谢...