并行模式:GROMACS支持多种并行模式,但需注意不同并行组合的性能差异。MPI安装:若进行跨节点计算,需安装MPI软件。单节点运行时则无需安装MPI。数学库选择:FFTW或Intel MKL:建议使用FFTW或Intel MKL库以支持快速傅立叶变换。FFTW通常提供更好的性能。cmake参数设置:在安装过程中,可使用cmake参数来设...
首先,请自行安装openssl 之后,还是下载-解包-编译的流程: $ wget https://github.com/Kitware/CMake/releases/download/v3.20.2/cmake-3.20.2.tar.gz $ tar -xzvf cmake-3.20.2.tar.gz $cdcmake-3.20.2/ $ mkdir my-install $ ./bootstrap --prefix=/home/zwnie/software/cmake-3.20.2/my-install...
如果您尚未安装CMake,请按照您的操作系统进行安装。例如,在Ubuntu上,您可以使用以下命令安装CMake: bash sudo apt-get update sudo apt-get install cmake 在Windows上,您可以从CMake官方网站下载并安装CMake。 创建一个构建目录并进入: bash mkdir build cd build 使用CMake配置安装,指定源代码路径和生成路...
版本:v0.1 上传日期:20110720 编程软件:VS2010 程序说明:http://good.gd/1419522.htm ...
1.获取最新版本的C和C++编译器。 2.检查您是否拥有CMake 3.18.4或更高版本。 3.获取并打开最新版本的GROMACS压缩包。 4.制作一个单独的构建目录并更改为该目录。 5.运行“cmake”,并将源路径作为参数 6.运行“make”、“make check”和“make install” ...
1、安装cmake #cd /usr/local #tar zxvf cmake-3.7.0.tar #cd cmake-3.7.0 #./bootstrap # gmake #gmake install 2、 安装fftw # cd .. # tar xvf fftw-3.3.tar.gz # cd fftw-3.3 #./configure --prefix=/opt/fftw --enable-threads --enable-shared ...
apt-getinstall cmake 二.显卡驱动和CUDA安装 1.显卡驱动 Ubuntu20.04安装之后已经有显卡驱动,但版本较旧,需要更改。在左下角显示应用程序中 选择“软件与更新” “附加驱动” 更改为合适的驱动版本,这里选择了510版本。 另可以 下载显卡驱动手动安装 参考: ...
GROMACS是广泛应用于模拟生物分子性质的分子动力学软件,具有运算速度快、开源免费、力场丰富、功能强大等优势。软件基于C/C++编写,代码量庞大,支持单精和双精模式,单精模式因运算速度快而更受欢迎。GROMACS的工作流程包括前处理、模拟和后处理三个阶段。安装GROMACS时,推荐使用镜像安装,源码安装较为复杂...
Public/backup repository of the GROMACS molecular simulation toolkit. Please do not mine the metadata blindly; we use https://gitlab.com/gromacs/gromacs for code review and issue tracking. - gromacs/CMakeLists.txt at main · wahello/gromacs
再次cmake3 .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX这一步操作时依旧报错,提示如下,CMake Error: Could not ...