首先,请自行安装openssl 之后,还是下载-解包-编译的流程: $ wget https://github.com/Kitware/CMake/releases/download/v3.20.2/cmake-3.20.2.tar.gz $ tar -xzvf cmake-3.20.2.tar.gz $cdcmake-3.20.2/ $ mkdir my-install $ ./bootstrap --prefix=/home/zwnie/software/cmake-3.20.2/my-install...
sudo apt install g++ 2) cmake&make 要配置编译文件和后续的安装,必须用到cmake和make,make一般在安装系统后就自带了,cmake需要自行下载,代码如下: sudo apt update sudo apt install make sudo apt install cmake 如果是普通用户,需要手动下载cmake,这里是链接cmake,个人不建议下载最新版的cmake,以防兼容性...
1.在做碳纳米管中的生长，使用lammps时，可以将整个管子固定，并且忽略掉管子中C-C的相互作用，只考虑...
Public/backup repository of the GROMACS molecular simulation toolkit. Please do not mine the metadata blindly; we use https://gitlab.com/gromacs/gromacs for code review and issue tracking. - gromacs/CMakeLists.txt at main · wahello/gromacs
Gromacs是一种广泛应用于生物物理和化学领域的分子动力学模拟软件。它可以用来研究生物分子的结构和动力学,以及了解它们与周围溶剂环境的相互作用。在Gromacs中,使用-wcl指令可以用来计算系统的总能量和保存能量输出。 -WCL指令: -wcl指令是Gromacs中的一个选项,代表‘write COORD and Lammps EnerGy’。这个指令可以用于...
1.2 cmake 安装 命令行输入 cmake -version 查看版本,若低于3.13需要重新安装,如下: 上传源码包 cmake-3.20.5.tar.gz 至 /public/home/username/sourcecode 目录下,并执行以下命令: tar zxvf cmake-3.20.5.tar.gz #解压cd cmake-3.20.5 #进入目录./bootstrap #编译&安装makemake install ...
Colvars-patched GROMACS releases; CI disabled until it is fixed in standard GROMACS - gromacs/cmake/gmxCFlags.cmake at cd98527261280973c66dd7edadee532b1093ac7e · Colvars/gromacs
如果您尚未安装CMake,请按照您的操作系统进行安装。例如,在Ubuntu上,您可以使用以下命令安装CMake: bash sudo apt-get update sudo apt-get install cmake 在Windows上,您可以从CMake官方网站下载并安装CMake。 创建一个构建目录并进入: bash mkdir build cd build 使用CMake配置安装,指定源代码路径和生成路...
gmx grompp -f em2.mdp -c em1.gro -p topol.top -o em2.tpr gmx mdrun_d -v -deffnm em2 For a minimization using the conjugate gradient method, GROMACS compiled in double precision should be used with the module ofmdrun_d. The .mdp file used at this step is: ...
方法/步骤 1 首先：(1) 解压缩fftw，lam-mpi，gromacs源码 tar -zxvf fftw-3.1.2.tar.gz tar –zxvf gromacs-3.3.1.tar.gz tar -zxvf lam-7.1.3.tar.gz 2 (2)编译lam-mpi cd lam-7.1.3 ./configure --prefix=/home/lam-7.1.3 --without-fc --with-rsh="ssh-x" make make install...