首先,我们需要安装Pytorch Geometric并导入所需的类: !pip install torch-geometricfromtorch_geometric.datasetsimportPlanetoidfromtorch_geometric.transformsimportNormalizeFeaturesfromtorch_geometric.utils.convertimportfrom_networkx AI代码助手复制代码 接着,我们可以使用from_networkx函数将NetworkX图转换为Pytorch Tensor格式...
2. pytorch-geometric(pyg)介绍 2.1 图数据建模 2.2 常用基准数据集 2.3 微批次(Mini-batches) 2.4 数据变换(Data Transforms) 3 GCN实现 3.1 谱方法GCN实现(Cora引文节点分类例子) 3.2 消息传递实现GCN 4 Cora GCN节点分类实战 4.1 通用图神经网络堆栈 4.2 归纳式GCN GraphSAGE实现 4.3 图注意力网络 GAT实现 ...
使用PyTorch Geometric(PyG) 自己实现SAGEConv GraphSAGE也是GNN领域的里程碑式成果,发表于NIPS 2017: 归纳式(Inductive)vs 直推式(Transductive):以往的图嵌入方法大多是直推式(Transductive)的,需要在训练时看到图中所有节点。这导致这些方法无法直接推广到新的节点或图,限制了其在动态变化图上的应用。 节点嵌入 vs...
GraphSAGE 通过忽略大多数节点来纠正这种情况。 在PyG 中,邻居采样是通过一个对象来实现的[ 邻居加载器](https://pytorch-geometric.readthedocs.io/en/latest/modules/loader.html#torch_geometric.loader.NeighborLoader).假设我们需要 5 个邻居和这 5 个邻居中的 10 个 (num_neighbors)。如前所述,我们可以定义...
由于torch_geometric中集成了单层的SAGEConv模块，这里直接进行导入，若有兴趣可以自行实现该类，注意输入与输出对齐即可。此外，数据集用的是CiteSeer，该数据集也直接集成在Planetoid模块中，这里也需要将其import进来。[2]:# 导入GraphSAGE层 from torch_geometric .nn import SAGEConv from torch_geometric .datasets ...
实现谱域图卷积网络（GCN）和其变种，如GraphSAGE和GAT，需要理解它们的基本原理和PyTorch中相关库的使用。首先，从安装PyTorch-geometric（pyg）开始，它是处理图数据操作的核心库。PyG包含丰富多样的基准数据集，如Planetoid、图分类数据集和3D图形数据，数据加载时会自动处理并提供索引访问。微批次（Mini-...
本文主要介绍了如何在昇腾上,使用pytorch对经典的图神经网络GraphSage在论文引用CiteSeer数据集上进行分类训练的实战讲解。内容包括GraphSage创新点分析、GraphSage算法原理、GraphSage网络架构剖析与GraphSage网络模型代码实战分析等等。 本实验的目录结构安排如下所示: ...
深入浅出GCN、GAT、GraphSage,MPNN等图神经网络模型【贪心学院】 1020 -- 13:17 App GraphSAGE、FastGCN、DropEdge采样的数学原理解析 25.5万 2390 20:31:26 App 【图神经网络】GNN从入门到精通 2214 3 11:19 App 动手学图神经网络系列-基于pytorchgeometric(一) 1.7万 24 3:47 App 图神经网络系列讲解及...
batch (torch_geometric.Data or torch_geometric.HeteroData): The PyTorch Geometric data object to classify. get_probs (bool, optional): Return the softmax scores of the raw logits, which can be interpreted as probabilities. Defaults to false. target_type (str, optional): Name of the vertex...
如果我们使用pytorch的PyG也能很方便调用: # -*- coding: utf-8 -*- """ Created on Fri Oct 8 23:16:13 2021 @author: 86493 """ importtorch fromtorch_geometric.datasetsimportPlanetoid fromtorch_geometric.transformsimportNormalizeFeatures