最后,将annotation CSV文件与表达矩阵结合。通过探针编号作为桥梁,可以轻松匹配并获取基因符号(gene_symbol)、染色体位置等详细信息。遵循上述步骤,即可实现从ID_REF到Gene_Symbol的转换,为后续的GEO数据库数据分析工作提供关键信息。
使用的GEO数据集:GSE3494 数据集简介:包含315名妇女的乳腺肿瘤标本组成的数据集。包含ER状态、PR状态、肿瘤等级(低、中、高)、淋巴结状态、患者年龄、预后情况等临床病理特征。 临床病理特征的获取: 直接复制在线表格,获取临床病理特征 直接复制在线表格获取患者编号(INDEX,ID)和GEO检索号之间的对应关系: 获取表达矩阵...
文档标签: GSW GeoRef数据库 GeoRef American Society Geological AAPG Institute AGI 数据库 系统标签: georef gsw 数据库 geoscienceworld 检索词 地质 GeoScienceWorld(GSW)是由7家地球科学领域的顶尖协会共同建立的非营利型组织,包括:美国石油地质师学会AmericanAssociationofPetroleumGeologists(AAPG)、美国地质协会Ame...