GEO Sample (GSM) 样本ID号 GEO Series (GSE) study的ID号 GEO Dataset (GDS) 数据集的ID号 Gene Expression Omnibus ncbi.nlm.nih.gov/geo/ 资料库检索页面介绍 GEO资料库介面主要包括检索框、检索结果列表、检索结果限定选项、检索记录信息,导入数据库(Entry type)主要类型为:datasets、series、samples和platform...
GEO全称Gene Expression Omnibus data base,由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库(通过NCBI首页,All Databases下拉框中选择GEO DataSets)。收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据。2000年开始建立的时候,主要是表达芯片数据(如其名),但是之后随着数据库的流行,逐渐扩展业务到许多其它的高通量...
GEO，全称为Gene Expression Omnibus data base，由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。该数据库收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，包括但不限于表达芯片数据、甲基化数据、染色质结构数据和基因组-蛋白交互作用数据。GEO数据库的记录方式不仅包括原始数据、处理过的数据和...
生信入门第4课|GEO数据库使用教程及在线数据分析工具geogene高通量数据库 GEO数据库全称GENE EXPRESSION OMNIBUS,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据,也就是说只要是目前已经发表的论文,论文中涉及到的基因表达检测的数据都可以...
GeneExpressionOmnibus(GEO):GeneExpressionandMolecularAbundanceDataRepositoryRelatedsamplesandseriesThisbringsupanEntrezGEODataSetsresultsformPlatformAccessionPageAtypicalgeneexpressionanalysisexperiment:GEOArchitectureQueryingGEODataSetsGEOLinksinPubMedSearchResultsSampledetails:Curated,onlineresourceforgeneexpressiondatabrowsing,...
GEO Gene Expression Omnibus 基因表达数据库 网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ GEO的数据存储方式 GEO数据库具体存放四类数据:GSE、GDS、GSM、GPL GEO Series Study GSE号(GSExxx)对应的是整个研究项目的系列的数据,可能会涉及不同平台。 GEO DataSet GDS号(GDSxxx)对应的是一个同一平台的数据集,这些...
Methods: Here, five independent Gene Expression Omnibus (GEO) datasets were combined into a single cohort and analyzed using network biology approaches. Results: 11 modules identified by weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) showed significant association with the status...
GEO(Gene Expression Omnibus)数据库由美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)建立。该数据库存储了全球范围内科研工作者上传的高通量数据的初步分析结果,包括微阵列芯片、转录组二代测序表达量文件,甲基化结果文件等。GEO的结果文件可以免费下载,是进行数据挖掘的理想数据库。本文中...
Gene Expression Omnibus (GEO): Gene Expression and Molecular Abundance Data RepositoryRelated samples and seriesThis brings up an Entrez GEO DataSets results formPlatform Accession PageA typical gene expression analysis exper 3、iment:GEO ArchitectureQuerying GEO DataSetsGEO Links in PubMed Search ...