常用数据库 | Gene Expression Omnibus (GEO)mp.weixin.qq.com/s/yfb2JdvVBv_zqnjbmagK-A 一、 GEO数据库简介 主页:ncbi.nlm.nih.gov/geo/ GEO,全称Gene Expression Omnibus,由美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBD)于2000年创建并维护至今。初始建立的时候,主要存储表...
GEO全称Gene Expression Omnibus data base,由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库(通过NCBI首页,All Databases下拉框中选择GEO DataSets)。收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据。2000年开始建立的时候,主要是表达芯片数据(如其名),但是之后随着数据库的流行,逐渐扩展业务到许多其它的高通量...
图1:GEO主页 点击Search后进入搜索结果页面(图2),左侧可以对搜索结果进行进一步过滤,Organism可以指定物种名称,本次我们选择Homo sapiens;Study type可以指定数据的类型,如基因表达量数据,甲基化数据,基因变异数据等,本次我们选择基因表达量数据“Expression profiling by array”和“Expression profiling by high throughput...
GEOGEO的意思 GEO 英文缩写GEO 英文全称Gene Expression Omnibus 中文解释基因表达汇编 缩写分类生物科学 缩写简介NCBI为了支持公共使用和散布基因表达数据而进行的计划。该计划的目的是努力建立一个基因表达数据仓库和在线资源,用于从任何物种或人造的来源检索基因表达数据。
GEO，全称为Gene Expression Omnibus data base，由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。该数据库收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，包括但不限于表达芯片数据、甲基化数据、染色质结构数据和基因组-蛋白交互作用数据。GEO数据库的记录方式不仅包括原始数据、处理过的数据和...
英文缩写 GEO 英文缩写GEO 英文全称Gene Expression Omnibus 中文解释基因表达汇编 缩写简介 NCBI为了支持公共使用和散布基因表达数据而进行的计划。该计划的目的是努力建立一个基因表达数据仓库和在线资源,用于从任何物种或人造的来源检索基因表达数据。
GEO Gene Expression Omnibus 基因表达数据库 网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ GEO的数据存储方式 GEO数据库具体存放四类数据:GSE、GDS、GSM、GPL GEO Series Study GSE号(GSExxx)对应的是整个研究项目的系列的数据,可能会涉及不同平台。 GEO DataSet GDS号(GDSxxx)对应的是一个同一平台的数据集,这些...
GEO(GeneExpressionOmnibus)数据库,作为第 一个基因表达数据的公共贮存库,2000年7月在 NCBI上首次公布于众.创建GEO的最初目的是适 应高通量实验方法在将来的普遍发展,具有强大的 数据收录功能.因此,它有着极大灵活性和与时俱进 的设计风格,不需设立严格的登陆要求和标准.GEO ...
GEO是一个高通量芯片表达谱数据库，主要用来存储和检索通过high-throughput gene expression、genomic hybridization和antibody array experiments等方法获取的数据信息。作为信息数据集中和发布的枢纽，GEO为传统实验室数据资源提供了有效的补充。GEO主要通过三个入口进行访问和检索。首先是GPL Platforms（平台），它...