GEO是什么? GEO全称Gene Expression Omnibus data base,由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库(通过NCBI首页,All Databases下拉框中选择GEO DataSets)。收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据。2000年开始建立的时候,主要是表达芯片数据(如其名),但是之后随着数据库的流行,逐渐扩展业务到许多...
2.1Data retrieval Gene Expression Omnibus (GEO) database was accessed to retrieve the dataset for this study. GEO is an open-access database that contains array- and sequence-based data on various disorders (Barrett et al., 2013). GEO also incorporates tools that help analyze curatedgen...
GEO，全称为Gene Expression Omnibus data base，由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。该数据库收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，包括但不限于表达芯片数据、甲基化数据、染色质结构数据和基因组-蛋白交互作用数据。GEO数据库的记录方式不仅包括原始数据、处理过的数据和...
The Gene Expression Omnibus (GEO) database is an international public repository that archives and freely distributes high-throughput gene expression and other functional genomics data sets. Created in 2000 as a worldwide resource for gene expression studies, GEO has evolved with rapidly changing tech...
常用数据库 | Gene Expression Omnibus (GEO)mp.weixin.qq.com/s/yfb2JdvVBv_zqnjbmagK-A 一、 GEO数据库简介 主页:ncbi.nlm.nih.gov/geo/ GEO,全称Gene Expression Omnibus,由美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBD)于2000年创建并维护至今。初始建立的时候,主要存储表...
GEOparse Python library to access Gene Expression Omnibus Database (GEO). GEOparse is python package that can be used to query and retrieve data from Gene Expression Omnibus database (GEO). The inspiration and the base for it is great R library GEOquery. ...
The Gene Expression Omnibus (GEO) database, the first public repository for gene expression data, premiered at National Center for Biotechnology Information(NCBI) in July 2000. The GEO database contains a wide assortment of high-throughput experimental data, including single and dual channel microarr...
GEO数据库的数据挖掘以及GEO在分子生物学领域中的应用前景.GEO可由此公众网址直接登陆 http:PP.ncbi.nlm.nih.govPprojectsPgeoP. 关键词基因表达;数据库;控制词汇;数据挖掘 中图分类号Q254;Q26 GEO(GeneExpressionOmnibus):High-throughput GeneExpressionDatabase ...
GEO Gene Expression Omnibus 基因表达数据库 网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ GEO的数据存储方式 GEO数据库具体存放四类数据:GSE、GDS、GSM、GPL GEO Series Study GSE号(GSExxx)对应的是整个研究项目的系列的数据,可能会涉及不同平台。 GEO DataSet GDS号(GDSxxx)对应的是一个同一平台的数据集,这些...
The GEO lists genes by name, type, organism, database, etc. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gds .doi:10.1007/978-1-4020-6754-9_6822George P. RédeiSpringer NetherlandsThe Gene Expression Omnibus (GEO) 2007 [http:// www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/]....