b=merge(a,tmp,by.x='GB_LIST',by.y='accession') head(b) d=toTable(org.Hs.egSYMBOL) f=merge(b,d,by='gene_id') head(f) 得到的结果如下: > head(f) gene_id GB_LIST ID symbol 1 1 W25099 338005 A1BG 2 10 NM_000015 118081 NAT2 3 100 NM_000022 494110 ADA 4 1000 NM_00179...
b=merge(a,tmp,by.x='GB_LIST',by.y='accession') head(b) d=toTable(org.Hs.egSYMBOL) f=merge(b,d,by='gene_id') head(f) 得到的结果如下: > head(f) gene_id GB_LIST ID symbol 1 1 W25099 338005 A1BG 2 10 NM_000015 118081 NAT2 3 100 NM_000022 494110 ADA 4 1000 NM_00179...
b=merge(a,tmp,by.x='GB_LIST',by.y='accession') head(b) d=toTable(org.Hs.egSYMBOL) f=merge(b,d,by='gene_id') head(f) 得到的结果如下: > head(f) gene_id GB_LIST ID symbol 1 1 W25099 338005 A1BG 2 10 NM_000015 118081 NAT2 3 100 NM_000022 494110 ADA 4 1000 NM_00179...
Gene name, GenBank and VectorBase accession number for each of the 8 nuclear Ixodes scapularis genes and the accession number for the 16S gene.Janice, Van ZeeJoseph, F. PiesmanAndrias, HojgaardWilliam, Cormack Black IV
b=merge(a,tmp,by.x='GB_LIST',by.y='accession')head(b)d=toTable(org.Hs.egSYMBOL)f=merge(b,d,by='gene_id')head(f) 得到的结果如下: 代码语言:javascript 复制 >head(f)gene_idGB_LISTIDsymbol11W25099338005A1BG210NM_000015118081NAT23100NM_000022494110ADA41000NM_001792490046CDH2510000U792713...
7,为什么RefSeq记录中的基因符号(symbol)有时和相关的GenBank中的不一样? RefSeq全部使用官方基因符号。而GenBank是一个公共的序列备份库,由数据发现者提供。有的作者会向相关的物种命名委员会取得官方基因符号,但有的作者没有,所以有时会产生别名。GenBank与Pubmed相同,通过display可以选择显示格式,常用的有GenBank...
7,为什么RefSeq记录中的基因符号(symbol)有时和相关的GenBank中的不一样? RefSeq全部使用官方基因符号。而GenBank是一个公共的序列备份库,由数据发现者提供。有的作者会向相关的物种命名委员会取得官方基因符号,但有的作者没有,所以有时会产生别名。GenBank与Pubmed相同,通过display可以选择显示格式,常用的有GenBank...
TheRefSeqdatabase of reference sequences assigns formal locus names to each record, based on gene symbol. RefSeq is separate from the GenBank database, but contains cross-references to corresponding GenBank records. Entrez Search Field: Accession Number [ACCN] Search Tip : It is better to searc...
TheLOCUSfieldcontainsanumberofdifferentdataelements,includinglocusname,sequence length,moleculetype,GenBankdivision,andmodificationdate.Eachelementisdescribedbelow. 二、COMMENT 1、REVIEWEDREFSEQ:说明了该RefSeq生成的过程。 2、Summary:说明了该序列的功能。 三、Feature名词解释:informationaboutgenesandgeneproducts,...
其规则如下:@gene(symbol) 限定其基因符号;@chr(num) 限定在第几号染色体;@lib(id) 限定其cDNA文库的Id号。(2)染色体浏览图谱定位的信息来源于孟德尔人类遗传学联机数据库、人类转录图谱和怀特海德基因组研究中心(Whitehead Institute Center for Genome Research)的物理图谱。点击某一染色体即可浏览该号染色体的...