multiqc ./01_fastqc -o ./01_multiqc 2>>log/multiqc_log.txt 四、 fastqc结果解读 (1) Basic Statistics ——基本统计 Filename:文件名。 File type:文件类型,一般是Conventional base calls。 Encoding:测序平台的版本和相应的编码版本号,用于计算Phred反推error P时用,一般是Sanger / Illumina 1.9。 Total ...
multiqc --help /project/fastqc_result/qc$ multiqc -n wes ./ python3下无法运行multiqc,所以先创建python2的wes环境 $ conda create-n wes python=2$ source activate wes 因为727个样本中有279个WXS数据,448个RNA-seq数据,所以这一步把html和zip文件分别进行整合到各自的html中,分组信息可以这里下载 https...
英国帝国理工Research Fellow 生物信息100问(第6期):FastQC和MultiQC批量评估FASTQ文件的质量 生物信息100问(第6期):FastQC和MultiQC批量评估FASTQ文件的质量_哔哩哔哩_bilibili www.bilibili.com/video/BV1kV411s7UU 发布于 2021-06-21 06:44 内容所属专栏 ...