箱子上面的须(up bar)为90%分位数,下面的须(down bar)为10%分位数,箱子中的红线为中位数即50%分位数,箱子顶(upside)为75%分位数,箱子低(downside)为25%分位数。这个boxplot的意义:一是看数据是否具有对称性;二是看数据分布差异,这里主要利用了第二点。bar的跨度越大,说明数据越不稳定。 蓝色的线将各...
fastqc-t2-f fastq-o fastqc_out/SRR19897* FastQC主要结果文件 代码语言:javascript 复制 # FastQC主要结果文件 SRR19897633_1_fastqc.html SRR19897633_2_fastqc.html SRR19897777_1_fastqc.html SRR19897777_2_fastqc.html FastQC会为每个输入文件生成一个以html为后缀的网页型结果,下面将以SRR19897633_1_fastqc....
fastqc $R1 $R2 这步会产生一个html文件,这就是fastqc的结果,我们可以双击在网页中打开进行查看。(详见下面介绍的fastqc报告解读) 2.png fastp 用于数据过滤 3.png fastp -i $R1 -I $R2 -o ../02clean/SRR15859344_1.clean.fastq.gz -O ../02clean/SRR15859344_2.clean.fastq.gz & 经过质控后的fast...
06_2【转录组分析】解读fastqc质控报告_20210328是06_2【转录组分析】解读fastqc质控报告(出现fail可能的原因)_20210328的第1集视频,该合集共计2集,视频收藏或关注UP主,及时了解更多相关视频内容。
guo-cheng#Learning-notes-2021#从头学习转录组之FastQC数据质控报告的详细解读1Ma**er 上传 2. Per base sequence quility:每个测序read上各碱基质量 3. Per sequence quility scores:每条序列质点赞(0) 踩踩(0) 反馈 所需:1 积分 电信网络下载
FastQC质控报告解读 一般FastQC分析结果产生有2种类型的文件,一种.zip,一种.html。直接点击.html文件,即可在浏览器中查看质控结果报告。 总览 Summary 首先是Summary,这一部分是整个报告的目录,整个报告分成若干个部分。合格会有绿色的对勾,警告是黄色感叹号,不合格是红叉。